269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0471 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 285 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  39.39 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0582  rod shape-determining protein MreC  41.46 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254357  hitchhiker  0.0000000000148886 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  38.37 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  37.2 
 
 		 300 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  37.96 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  35.92 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  36.02 
 
 		 311 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  36.64 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  37.4 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0656  rod shape-determining protein MreC  38.46 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0227203  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  33.84 
 
 		 334 aa  122  9e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  35.96 
 
 		 381 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  34.54 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  31.33 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  30.83 
 
 		 272 aa  95.9  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  29.39 
 
 		 274 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1413  rod shape-determining protein MreC  34.2 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0196901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  27.85 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  31.15 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  29.5 
 
 		 326 aa  90.1  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  29.9 
 
 		 357 aa  90.1  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  31.79 
 
 		 369 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  32.37 
 
 		 367 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  30.68 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  31.21 
 
 		 369 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  36.17 
 
 		 247 aa  86.3  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  30.24 
 
 		 272 aa  85.9  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  35.85 
 
 		 309 aa  85.5  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  31.06 
 
 		 249 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  31.06 
 
 		 249 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  37.16 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  29.72 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  31.93 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  31.95 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  31.84 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  34.13 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  34.97 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  30.85 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01801  rod shape-determining protein MreC  32.68 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  30.74 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  31.78 
 
 		 362 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  31.78 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  26.36 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  29.93 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  28.45 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  31.36 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  29.46 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  33.16 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  28.7 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  31.14 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  31.51 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  32.95 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  29.63 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  29.17 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  26.38 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  30.64 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  30.64 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  30.64 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  30.64 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  30.64 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  30.64 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  30.64 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  32.64 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  33.77 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  26.5 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  32.12 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  31.98 
 
 		 355 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  30.23 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  26.5 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  32.18 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  31.07 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  33.89 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  25.93 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  30.73 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  32.3 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  32.96 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  32.64 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1380  rod shape-determining protein MreC  27.23 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2129  rod shape-determining protein MreC  34.34 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  33.51 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  30.23 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  30.23 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  28.97 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  25.96 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>