287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2547 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
272 aa  551  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  60.53 
 
 
274 aa  335  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  56.82 
 
 
274 aa  295  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  57.58 
 
 
274 aa  289  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  55.26 
 
 
274 aa  278  8e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  57.58 
 
 
273 aa  269  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  55.64 
 
 
274 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  43.66 
 
 
272 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  42.17 
 
 
277 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  36.6 
 
 
281 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  36.15 
 
 
359 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  31.97 
 
 
286 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  38.29 
 
 
357 aa  140  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  37.27 
 
 
291 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  33.08 
 
 
317 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  36.9 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  36.53 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  35.54 
 
 
291 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  32.22 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  32.58 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  29.14 
 
 
288 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  30.42 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  35.94 
 
 
273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  35.04 
 
 
274 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  28.52 
 
 
285 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  35.71 
 
 
283 aa  123  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  30.18 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  37.62 
 
 
304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  31.68 
 
 
292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  33.64 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  27.34 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  33.68 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  29.89 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  29.21 
 
 
277 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  33 
 
 
315 aa  112  8.000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  34.47 
 
 
276 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  32.44 
 
 
338 aa  112  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  29.87 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  30.3 
 
 
286 aa  110  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  30.3 
 
 
286 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  37.59 
 
 
249 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  37.59 
 
 
249 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  27.17 
 
 
286 aa  109  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  26.27 
 
 
306 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  33.19 
 
 
285 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  28.08 
 
 
311 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  30.4 
 
 
296 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  30.92 
 
 
317 aa  105  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  31.37 
 
 
288 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  29.78 
 
 
283 aa  105  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  30.4 
 
 
285 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  29.96 
 
 
299 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  29.39 
 
 
356 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  29.96 
 
 
291 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  37.93 
 
 
249 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  29.71 
 
 
285 aa  103  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  30.97 
 
 
304 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  31.8 
 
 
286 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 
311 aa  102  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  29.02 
 
 
309 aa  102  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  27.65 
 
 
283 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  33.19 
 
 
351 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  31.39 
 
 
288 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  26.75 
 
 
286 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  28.76 
 
 
296 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  26.49 
 
 
283 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  30.09 
 
 
296 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 
310 aa  99.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  29.79 
 
 
336 aa  99  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 
305 aa  99  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  35.92 
 
 
311 aa  98.6  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  31 
 
 
283 aa  98.6  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
305 aa  98.6  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  36.26 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  30.54 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  33.67 
 
 
319 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  32.78 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  28.36 
 
 
307 aa  97.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  31.08 
 
 
348 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  34.04 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
324 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  33.73 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  31.47 
 
 
407 aa  97.1  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  28.68 
 
 
279 aa  96.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  28.68 
 
 
279 aa  96.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  32.16 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  30.49 
 
 
348 aa  95.5  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  28.68 
 
 
306 aa  95.5  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  32.09 
 
 
331 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  32.09 
 
 
331 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  31 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  32.16 
 
 
381 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  32.09 
 
 
331 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  30.7 
 
 
448 aa  93.6  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  31.96 
 
 
346 aa  93.2  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  32.32 
 
 
267 aa  93.2  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  30.54 
 
 
316 aa  93.2  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  26.45 
 
 
279 aa  92.4  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 
316 aa  92.8  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>