260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0106 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 248 aa  476  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0150  rod shape-determining protein MreC  81.05 
 
 		 248 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01801  rod shape-determining protein MreC  69.33 
 
 		 247 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  51.84 
 
 		 247 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  53.3 
 
 		 251 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  52.42 
 
 		 251 aa  244  9e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  45.87 
 
 		 249 aa  221  7e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  48.13 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  47.69 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18131  rod shape-determining protein MreC  44.13 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570389  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  46.54 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  39.5 
 
 		 251 aa  162  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  43.84 
 
 		 257 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  40 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  40 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  40.69 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  36.55 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  36.12 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1209  Rod shape-determining protein MreC  32.64 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0276789  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  37.16 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  35.71 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  35.9 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  32.93 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  38.19 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  33.79 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  31.33 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  28.72 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  32.39 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  28.72 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  33.1 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  36.08 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  32.03 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  32.32 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  36.17 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  31.68 
 
 		 357 aa  75.5  0.0000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  32.61 
 
 		 329 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  32.61 
 
 		 330 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  30.74 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  30.86 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  26.11 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  28.95 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  32.53 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  34.72 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  29.55 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  34.71 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  29.13 
 
 		 369 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 267 aa  72  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  28.95 
 
 		 283 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  31.94 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  28.06 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  26.9 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  31.22 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  31.74 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  31.71 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  32.32 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  34.52 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  28.72 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  27.67 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  33.92 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  30.2 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  26.34 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  33.53 
 
 		 336 aa  69.3  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  34 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  27.66 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  29.33 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  34 
 
 		 316 aa  68.6  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  28.1 
 
 		 306 aa  68.6  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  31.69 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  27.73 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0852  rod shape-determining protein MreC  34.17 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0888455 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  27.73 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  31.69 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  27.69 
 
 		 285 aa  67  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  32.39 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  30.46 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  32.39 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  34.39 
 
 		 263 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  32.39 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  32.65 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  32.26 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  32.12 
 
 		 332 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  32.12 
 
 		 330 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  32.12 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  35.37 
 
 		 407 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  31.15 
 
 		 348 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0286  rod shape-determining protein MreC  27.67 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  32.34 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  32.34 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  33.8 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  28.16 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  28.12 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  32.34 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>