165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0852 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0852  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 248 aa  474  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0888455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1540  rod shape-determining protein MreC  40.65 
 
 		 327 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.211291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  51.92 
 
 		 298 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1686  rod shape-determining protein MreC  50 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  35.29 
 
 		 366 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7281  Cell shape-determining protein-like protein  35.43 
 
 		 317 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.205543 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1212  rod shape-determining protein MreC  37 
 
 		 327 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3464  rod shape-determining protein MreC  35 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.187709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7284  rod shape-determining protein MreC  34.55 
 
 		 290 aa  95.1  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5268  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 		 336 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  31.7 
 
 		 357 aa  88.2  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0749  rod shape-determining protein MreC  35.18 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  37.44 
 
 		 292 aa  82  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  34.55 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09210  cell shape-determining protein  32.77 
 
 		 425 aa  78.6  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.76787 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  34.18 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  29.1 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  29.95 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  34.95 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  30.48 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  35.33 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  34.17 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  29.76 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  29.76 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  33.01 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 288 aa  62  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  27.62 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  27.73 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  27.46 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  26.98 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1282  rod shape-determining protein MreC  33.17 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  25.69 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  32.07 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  24.15 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  30.54 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1671  rod shape-determining protein MreC  36.31 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575744 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  26.7 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1380  rod shape-determining protein MreC  32.94 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  26.49 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  23.92 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  29.73 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0150  rod shape-determining protein MreC  32.5 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  31.91 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  24.54 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  29.19 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  25.88 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  24.9 
 
 		 282 aa  57  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  29.19 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  30.86 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  30.29 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  32.45 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  29.94 
 
 		 283 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0040  rod shape-determining protein MreC  30.73 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  29.08 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  28.8 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  25.12 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  28.74 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  35.61 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  28.74 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  27.04 
 
 		 283 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01801  rod shape-determining protein MreC  32.18 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  25.15 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  25.15 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  27.06 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  28.65 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  29.8 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  31.02 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  27.54 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  26.75 
 
 		 369 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1190  rod shape-determining protein MreC  29.18 
 
 		 302 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.759069  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  31.65 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  29.3 
 
 		 369 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  31.65 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  28.37 
 
 		 333 aa  52.8  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 		 362 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  33.1 
 
 		 274 aa  52.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  27.97 
 
 		 306 aa  52  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  26.09 
 
 		 286 aa  52  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  27.6 
 
 		 283 aa  52  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  31.41 
 
 		 251 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  31.75 
 
 		 273 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  27.04 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  28.1 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0106  Rod shape-determining protein MreC  26.26 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  28.17 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  30.46 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  24.19 
 
 		 291 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  29.74 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  30.59 
 
 		 295 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  29.9 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  28.72 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>