157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0749 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0749  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
323 aa  627  1e-179  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302394  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1540  rod shape-determining protein MreC  45.26 
 
 
327 aa  225  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.211291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  42.71 
 
 
366 aa  209  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7284  rod shape-determining protein MreC  45.67 
 
 
290 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7281  Cell shape-determining protein-like protein  42.96 
 
 
317 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.205543 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1212  rod shape-determining protein MreC  40.81 
 
 
327 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5268  rod shape-determining protein MreC  41.07 
 
 
336 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3464  rod shape-determining protein MreC  39.93 
 
 
302 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.187709  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  39.24 
 
 
298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1686  rod shape-determining protein MreC  39.81 
 
 
273 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0852  rod shape-determining protein MreC  33.58 
 
 
248 aa  92.4  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0888455 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09210  cell shape-determining protein  36.49 
 
 
425 aa  90.1  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.76787 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  27.47 
 
 
286 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  30.18 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  31.77 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  29.63 
 
 
277 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  28.85 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  30.36 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  26.55 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  26.74 
 
 
359 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0767  rod shape-determining protein MreC  34.45 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0236544  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  31.44 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  32.28 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  23.53 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  28.03 
 
 
304 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  27.76 
 
 
288 aa  67  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1528  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.187391  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  25.89 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  30.43 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  28.82 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  26.23 
 
 
287 aa  65.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  24.9 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  36.42 
 
 
266 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  24.69 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  28.1 
 
 
292 aa  64.3  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  24.58 
 
 
283 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  26.1 
 
 
272 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  34.04 
 
 
274 aa  64.3  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  24.58 
 
 
283 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  32.05 
 
 
251 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  30.41 
 
 
280 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  29.79 
 
 
296 aa  63.9  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  30.89 
 
 
292 aa  63.5  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  25.33 
 
 
306 aa  62.8  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  26.45 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  31.6 
 
 
273 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  26.54 
 
 
300 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  26.54 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  26.47 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  30.62 
 
 
299 aa  60.5  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  30.99 
 
 
288 aa  60.1  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  29.73 
 
 
296 aa  60.1  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  23.9 
 
 
277 aa  60.1  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 
291 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  28.22 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  26.07 
 
 
281 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  32.34 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  23.72 
 
 
286 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  31.71 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  27.23 
 
 
280 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  27.23 
 
 
280 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  27.98 
 
 
299 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  24.57 
 
 
283 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  26.61 
 
 
283 aa  56.2  0.0000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  25.83 
 
 
336 aa  56.2  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  23.4 
 
 
283 aa  56.2  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  26.19 
 
 
257 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  29.03 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  24.35 
 
 
283 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  25.8 
 
 
317 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  25.45 
 
 
296 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  23.51 
 
 
286 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  28.83 
 
 
271 aa  53.9  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1403  Rod shape-determining protein MreC  25.49 
 
 
268 aa  53.5  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000400857  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  27.08 
 
 
324 aa  53.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0807  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 
278 aa  53.1  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1457  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
276 aa  53.1  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  30.2 
 
 
257 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  27.62 
 
 
338 aa  53.1  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00570  rod shape-determining protein  26.34 
 
 
257 aa  53.1  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119359  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 
279 aa  52.8  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  25.42 
 
 
255 aa  53.1  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  23.91 
 
 
283 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  34.45 
 
 
249 aa  52.8  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  31.07 
 
 
288 aa  52.8  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  23.51 
 
 
287 aa  52.8  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1395  rod shape-determining protein MreC  34.01 
 
 
295 aa  52.8  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0343017 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  27.21 
 
 
291 aa  52.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  29.63 
 
 
348 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  27.07 
 
 
263 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  25.83 
 
 
274 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  27.97 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  28.97 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  26.9 
 
 
283 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  27.82 
 
 
273 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  27.38 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0839  Rod shape-determining protein MreC  21.62 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0866  rod shape-determining protein MreC  27.83 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>