257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0472 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 315 aa  620  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  70.21 
 
 		 300 aa  384  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  70.57 
 
 		 300 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  69.96 
 
 		 304 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  61.06 
 
 		 299 aa  358  8e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  62.21 
 
 		 311 aa  351  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  62.5 
 
 		 310 aa  344  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  41.29 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  35.61 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  34.31 
 
 		 381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0582  rod shape-determining protein MreC  33.1 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254357  hitchhiker  0.0000000000148886 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  32.62 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  28.31 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0656  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0227203  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  28.52 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  30.49 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  30.99 
 
 		 273 aa  92.8  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 		 257 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  30.54 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  28.12 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  31.66 
 
 		 291 aa  89.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  30.09 
 
 		 286 aa  89  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  26.34 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  31.51 
 
 		 292 aa  86.7  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  28.46 
 
 		 304 aa  86.3  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  29.78 
 
 		 272 aa  85.9  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  30.94 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  32.95 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  29.26 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  29.61 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  32.99 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  30.57 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  31.55 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  28.96 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  31.55 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  30.64 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  28.05 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  27.5 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  27.5 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  31.49 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  28.02 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  29 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1628  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  26.89 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  30.6 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  27.34 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  29.39 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  27.24 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  29.06 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  25.45 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1413  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0196901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  33.82 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2129  rod shape-determining protein MreC  31.98 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  26.34 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  27.14 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  33.9 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  33.9 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  33.9 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  28.62 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  33.15 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  32.07 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  29.55 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  28.83 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  33.54 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  27.35 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  29.26 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  26.02 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  30.53 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  27.88 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  26.54 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  32.77 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  32.77 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  22.12 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 		 286 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  25.27 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  23.16 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  29.34 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  29.7 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  29.05 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0749  rod shape-determining protein MreC  32.03 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  29.07 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  26.99 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  27.31 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  26.97 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>