199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0656 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0656  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 285 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0227203  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0582  rod shape-determining protein MreC  43.28 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254357  hitchhiker  0.0000000000148886 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  38.46 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  34.7 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  32.05 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  32.34 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  32.17 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  32.31 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  34.96 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  33.91 
 
 		 334 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  31.74 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  31.74 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  32.31 
 
 		 381 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  29.18 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  29.18 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  27.35 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  27.35 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  27.35 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  27.85 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  28.31 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  28.81 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  29.09 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  26.48 
 
 		 326 aa  72  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  30.99 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  27.1 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  24.22 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  28.36 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  24.07 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  29.79 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  29.79 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  27.76 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  30.47 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  24.61 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2129  rod shape-determining protein MreC  33.53 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  30.71 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  28.1 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1628  rod shape-determining protein MreC  26.09 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  27.3 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  26.01 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  25.98 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  25.1 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  27.42 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  25.33 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  26.83 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  25.32 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  27.62 
 
 		 330 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  28.74 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  30.53 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  27.2 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  25.62 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  26.75 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  28.89 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  30.54 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  29.74 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  27.34 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  27.05 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  27.16 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  26.72 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  32.64 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  26.23 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  27.88 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  26.88 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  27.35 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  26.48 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  29.51 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  26.23 
 
 		 357 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0264  rod shape-determining protein MreC  29.13 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.032676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  27.05 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  29.31 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  34.87 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  26.3 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  27.59 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  31.09 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4410  rod shape-determining protein MreC  29 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000283267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  25.68 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  27.69 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  28.03 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  26.17 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  26.82 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  33.05 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  25.22 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  31.09 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  27.35 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  33.93 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  32.24 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  27.95 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  26.75 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  26.44 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  26.23 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3686  rod shape-determining protein MreC  27.71 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000135967  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03109  cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreC  28.14 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0024282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0457  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000354374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3733  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 367 aa  57  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4566  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000293229  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3439  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626675  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  26.34 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>