236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2016 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 334 aa  650    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  38.52 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  39.52 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  34.41 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  32.53 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  31.82 
 
 		 299 aa  126  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  31.36 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  30.93 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  33.84 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  30.93 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  33.19 
 
 		 315 aa  119  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0582  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 301 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254357  hitchhiker  0.0000000000148886 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  34.12 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  29.13 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  29.05 
 
 		 274 aa  92.4  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  25.19 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  32.16 
 
 		 329 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  32.44 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  32.31 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0656  rod shape-determining protein MreC  33.91 
 
 		 285 aa  90.1  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0227203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  32.39 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  33.49 
 
 		 254 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  27.44 
 
 		 357 aa  89  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  27.82 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  28.97 
 
 		 274 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  30.21 
 
 		 300 aa  86.7  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 		 274 aa  86.3  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  34.44 
 
 		 298 aa  85.9  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  26.99 
 
 		 414 aa  85.9  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  27.38 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  32.03 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  31.74 
 
 		 369 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  31.74 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  27.43 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  26.34 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  32.74 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  37.11 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  26.99 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  26.99 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  29.76 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  26.99 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  35.03 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  31.78 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  28.98 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  34.39 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  28.72 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  29.81 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  34.39 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  28.34 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  28.34 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  30.47 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  32.9 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  25.57 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  30.9 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  34.38 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  28.23 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  32.97 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  32 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  27.24 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  27.74 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  31.95 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  31.95 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  31.95 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  32.93 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  31.95 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  31.95 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  31.95 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  31.95 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  37.72 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  29.6 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  29.6 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  32.35 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  33.53 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  37.72 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  28.65 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  30.64 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  31.76 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  31.76 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  31.76 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  25.99 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  29.24 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  27.59 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  22.55 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  32.1 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  32.87 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  28.7 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  36.27 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  25.79 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  36.27 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  26.2 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  28.65 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>