263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4033 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 310 aa  616  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  72.16 
 
 		 300 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  72.53 
 
 		 300 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  71.17 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  62.63 
 
 		 299 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  64.86 
 
 		 311 aa  363  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  64.81 
 
 		 315 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  41.85 
 
 		 317 aa  195  7e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  36.1 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  38.64 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  31.14 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0582  rod shape-determining protein MreC  34.65 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254357  hitchhiker  0.0000000000148886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  33.47 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0656  rod shape-determining protein MreC  31.15 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0227203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  29.96 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  35.67 
 
 		 257 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  31.51 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  30.37 
 
 		 286 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 		 281 aa  93.2  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  26.94 
 
 		 274 aa  92.8  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  32.99 
 
 		 300 aa  92.8  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  28.28 
 
 		 274 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  34.09 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 		 285 aa  90.9  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  31.91 
 
 		 346 aa  89.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  28.68 
 
 		 286 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  31.12 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1628  rod shape-determining protein MreC  30.3 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  27.88 
 
 		 336 aa  89.4  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  34.17 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  29.46 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2129  rod shape-determining protein MreC  32.56 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  32.37 
 
 		 348 aa  86.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  34.5 
 
 		 357 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  34.5 
 
 		 357 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  34.5 
 
 		 357 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  34.5 
 
 		 357 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  34.5 
 
 		 357 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  32.02 
 
 		 251 aa  86.3  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  34.5 
 
 		 357 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  32.37 
 
 		 348 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  34.5 
 
 		 357 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  31.44 
 
 		 286 aa  85.9  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  29.46 
 
 		 273 aa  86.3  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  31.4 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  28.32 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  33.73 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  29.96 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  30.84 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  31.61 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  27 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  32.75 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  33.92 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  32.75 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  32.75 
 
 		 358 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  33.53 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  29.95 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01801  rod shape-determining protein MreC  35.19 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  28.52 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  32.75 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  29.79 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  29.36 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  34.24 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  28.96 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  29.76 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  28.85 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  28.85 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  33.14 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  24.9 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  33.14 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  28.64 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  28.64 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  27.11 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  26.05 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  27.75 
 
 		 414 aa  79.3  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  28.89 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  28.78 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  28 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  30.99 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  29.26 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  32.65 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  33.7 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  32.07 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  29.8 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  32.14 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  33.7 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  30.08 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  30.86 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  29.39 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  33.52 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  32.37 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  28.11 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  29.19 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  32.35 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  28.43 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>