265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0101 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
300 aa  595  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  44.44 
 
 
328 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  44.13 
 
 
281 aa  221  9e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  45.74 
 
 
329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  53.02 
 
 
310 aa  219  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  45.53 
 
 
330 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  44.79 
 
 
318 aa  217  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  42.26 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  43.97 
 
 
286 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  40.89 
 
 
293 aa  209  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  40.29 
 
 
296 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  43.28 
 
 
362 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  39.86 
 
 
334 aa  206  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  41.97 
 
 
317 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  40.29 
 
 
299 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  43.53 
 
 
359 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  39.78 
 
 
294 aa  202  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  43.53 
 
 
357 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  44.09 
 
 
292 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  44.05 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  51.76 
 
 
330 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  48.61 
 
 
333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  47.39 
 
 
325 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  42.12 
 
 
338 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0498  rod shape-determining protein MreC  42.12 
 
 
336 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000920661  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  42.12 
 
 
336 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  42.12 
 
 
336 aa  195  7e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3471  rod shape-determining protein MreC  41.76 
 
 
353 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0021778  normal  0.815632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0480  rod shape-determining protein MreC  41.76 
 
 
353 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.589731  normal  0.326651 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3647  rod shape-determining protein MreC  41.76 
 
 
353 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0178406  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  37.92 
 
 
309 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  41.64 
 
 
298 aa  193  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  40.7 
 
 
298 aa  192  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4097  rod shape-determining protein MreC  41.39 
 
 
355 aa  192  7e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  42.26 
 
 
310 aa  190  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  37.04 
 
 
292 aa  190  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  39.42 
 
 
296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  43.95 
 
 
254 aa  188  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  38.28 
 
 
326 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  37.78 
 
 
414 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  36.67 
 
 
292 aa  186  4e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3737  rod shape-determining protein MreC  40.52 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00218266  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  39.71 
 
 
351 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  39.06 
 
 
267 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  38.76 
 
 
331 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  38.76 
 
 
331 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  38.76 
 
 
331 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  37.4 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  39.7 
 
 
292 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  42.4 
 
 
243 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  37.22 
 
 
285 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  40.15 
 
 
298 aa  170  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3753  rod shape-determining protein MreC  38.93 
 
 
295 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000670381  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  40.38 
 
 
302 aa  169  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  40.38 
 
 
302 aa  169  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  37.88 
 
 
277 aa  168  9e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3834  rod shape-determining protein MreC  38.52 
 
 
383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0283563  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  37.96 
 
 
369 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  37.09 
 
 
324 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  36.56 
 
 
367 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4410  rod shape-determining protein MreC  38.37 
 
 
334 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000283267  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  36.13 
 
 
367 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  36.5 
 
 
369 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  35.46 
 
 
359 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  36.98 
 
 
336 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  35.79 
 
 
357 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  35.79 
 
 
357 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  35.79 
 
 
357 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  35.79 
 
 
357 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  35.79 
 
 
357 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  35.79 
 
 
357 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  35.79 
 
 
357 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  36.53 
 
 
356 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  36.13 
 
 
355 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  36.53 
 
 
356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  35.4 
 
 
358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  35.4 
 
 
358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  35.4 
 
 
358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3686  rod shape-determining protein MreC  38.76 
 
 
338 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000135967  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03109  cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreC  38.37 
 
 
367 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0024282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0457  rod shape-determining protein MreC  38.37 
 
 
367 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000354374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3545  rod shape-determining protein MreC  38.37 
 
 
367 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000398804  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3281  rod shape-determining protein MreC  38.37 
 
 
361 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000057378  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  37.59 
 
 
316 aa  154  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4566  rod shape-determining protein MreC  38.37 
 
 
367 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000293229  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3439  rod shape-determining protein MreC  38.37 
 
 
367 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626675  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03060  hypothetical protein  38.37 
 
 
367 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00317154  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3733  rod shape-determining protein MreC  38.37 
 
 
367 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011451  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0264  rod shape-determining protein MreC  37.21 
 
 
327 aa  153  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.032676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  35.69 
 
 
311 aa  153  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3733  rod shape-determining protein MreC  37.98 
 
 
350 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0325244  normal  0.0423358 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3671  rod shape-determining protein MreC  37.98 
 
 
350 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208863  normal  0.389982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3564  rod shape-determining protein MreC  37.98 
 
 
350 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00821336  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  33.73 
 
 
288 aa  152  8.999999999999999e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3636  rod shape-determining protein MreC  37.98 
 
 
350 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0150726  hitchhiker  0.00366072 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3565  rod shape-determining protein MreC  37.98 
 
 
350 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.145579  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  37.22 
 
 
316 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  37.08 
 
 
407 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0457  rod shape-determining protein MreC  37.98 
 
 
367 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00301189  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  37.86 
 
 
348 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>