238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1628 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1628  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 300 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2129  rod shape-determining protein MreC  44.85 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  42.08 
 
 		 291 aa  189  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  34.67 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  35.16 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  30.23 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  34.39 
 
 		 311 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  33.51 
 
 		 300 aa  95.5  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  34.83 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  36.61 
 
 		 369 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  36.16 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  36.16 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  36.63 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  31.08 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  36.61 
 
 		 369 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  30.52 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  27.37 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  34.78 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  34.78 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  36.81 
 
 		 348 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  30.13 
 
 		 310 aa  89.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  27.71 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  36.26 
 
 		 348 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  28.31 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  32.3 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  32.05 
 
 		 254 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  30.57 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  35.71 
 
 		 367 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  35.68 
 
 		 346 aa  86.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  33.86 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  33.86 
 
 		 330 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  26.99 
 
 		 296 aa  85.5  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  37.19 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  27.5 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  30.48 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  34.76 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  29.28 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  27.5 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  31.91 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  34.59 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  31.73 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  34.25 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  29.79 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  31.37 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  27.97 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  27.97 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  27.97 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  34.57 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  34.95 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  34.59 
 
 		 357 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  34.59 
 
 		 359 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  34.04 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  27.46 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  34.04 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  35.14 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  35.4 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  34.41 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  33.16 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  37.13 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  28.47 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  34.43 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  32.41 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  34.43 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  34.43 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 281 aa  80.1  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  34.41 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  34.05 
 
 		 407 aa  79.3  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  33.88 
 
 		 355 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  27.73 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  31.66 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  33.7 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  33.7 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  33.9 
 
 		 367 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  32.79 
 
 		 359 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  27.78 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  29.6 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  29.21 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  29.79 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  32.24 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  32.24 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  32.24 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  32.24 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  36 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  32.24 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  32.24 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  37.7 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  32.24 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  36 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1671  rod shape-determining protein MreC  26.97 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575744 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  32.14 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4410  rod shape-determining protein MreC  28.33 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000283267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  27.75 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  38.68 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0253  rod shape-determining protein MreC  30.62 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00109654  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  26.34 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>