261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0319 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
298 aa  607  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  44.67 
 
 
336 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  45.14 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  46.29 
 
 
310 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  46.27 
 
 
348 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  46.27 
 
 
348 aa  239  5e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  44.28 
 
 
324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  45.9 
 
 
369 aa  232  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  45.15 
 
 
369 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  45.96 
 
 
292 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  44.03 
 
 
367 aa  225  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  42.07 
 
 
357 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  42.07 
 
 
357 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  42.07 
 
 
357 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  42.07 
 
 
357 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  42.07 
 
 
357 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  42.07 
 
 
357 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  42.07 
 
 
357 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  40.97 
 
 
359 aa  215  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  40.56 
 
 
358 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  40.56 
 
 
358 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  40.56 
 
 
358 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  41.43 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  42.91 
 
 
346 aa  212  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  41.79 
 
 
367 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  41.04 
 
 
356 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  41.04 
 
 
356 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  42.2 
 
 
307 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  40.22 
 
 
305 aa  209  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  40.22 
 
 
305 aa  208  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  39.93 
 
 
306 aa  202  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  40.22 
 
 
326 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  37.84 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  40.36 
 
 
306 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  41.04 
 
 
312 aa  193  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  40.36 
 
 
356 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  39.03 
 
 
329 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  38.89 
 
 
330 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  38.18 
 
 
328 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  40.15 
 
 
300 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  35.4 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  38.4 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  37.89 
 
 
286 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  38.91 
 
 
281 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  38.74 
 
 
357 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  38.74 
 
 
359 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  37.5 
 
 
362 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  38.01 
 
 
299 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  38.25 
 
 
310 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  36.8 
 
 
281 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  36.23 
 
 
311 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  39.13 
 
 
325 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  38.01 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  38.43 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  38.74 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1609  rod shape-determining protein MreC  38.77 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.72705  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  39.11 
 
 
333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  35.69 
 
 
286 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  37.65 
 
 
292 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  36.43 
 
 
296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  37.76 
 
 
243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  33.58 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  34.55 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  34.96 
 
 
326 aa  163  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  37.74 
 
 
285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  36.09 
 
 
292 aa  162  6e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  34.88 
 
 
293 aa  162  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 
316 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  38.55 
 
 
448 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 
316 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  35.71 
 
 
292 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  35.71 
 
 
414 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  35.86 
 
 
277 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  33.46 
 
 
317 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  36.33 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  35.66 
 
 
351 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  32.2 
 
 
267 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  32.98 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  35.69 
 
 
331 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  35.69 
 
 
331 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  35.69 
 
 
331 aa  152  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  36.78 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  34.24 
 
 
294 aa  151  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  36.72 
 
 
298 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0457  rod shape-determining protein MreC  35.55 
 
 
367 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00301189  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  37.89 
 
 
336 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  37.89 
 
 
338 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0498  rod shape-determining protein MreC  37.89 
 
 
336 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000920661  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03109  cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreC  35.55 
 
 
367 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0024282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0457  rod shape-determining protein MreC  35.55 
 
 
367 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000354374  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  37.89 
 
 
336 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3439  rod shape-determining protein MreC  35.55 
 
 
367 aa  149  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4566  rod shape-determining protein MreC  35.55 
 
 
367 aa  149  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000293229  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3545  rod shape-determining protein MreC  35.55 
 
 
367 aa  149  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000398804  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03060  hypothetical protein  35.55 
 
 
367 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00317154  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3733  rod shape-determining protein MreC  35.55 
 
 
367 aa  149  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011451  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3281  rod shape-determining protein MreC  35.55 
 
 
361 aa  149  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000057378  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3564  rod shape-determining protein MreC  35.55 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00821336  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3686  rod shape-determining protein MreC  35.55 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000135967  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3636  rod shape-determining protein MreC  35.55 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0150726  hitchhiker  0.00366072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>