252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0594 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 299 aa  593  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  67.16 
 
 		 300 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  63.32 
 
 		 311 aa  363  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  67.16 
 
 		 300 aa  361  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  66.42 
 
 		 304 aa  357  9e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  62.63 
 
 		 310 aa  348  5e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  61.06 
 
 		 315 aa  333  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  40.64 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  37.4 
 
 		 285 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  35.59 
 
 		 381 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  31.82 
 
 		 334 aa  126  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  32.89 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0582  rod shape-determining protein MreC  30.16 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254357  hitchhiker  0.0000000000148886 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0656  rod shape-determining protein MreC  36.73 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0227203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  34.04 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  29.33 
 
 		 306 aa  89.4  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  29.49 
 
 		 286 aa  89  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  29.78 
 
 		 286 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  25.74 
 
 		 274 aa  85.5  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  35.2 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  27.09 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  26.75 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1413  rod shape-determining protein MreC  30.68 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0196901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  32.66 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  25.76 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  31.82 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  32 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  30.48 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  29.39 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  26.25 
 
 		 281 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  28.75 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  28.35 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  28.71 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  28.75 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  26.72 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  28.71 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  30.85 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  31.74 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1628  rod shape-determining protein MreC  28.91 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2129  rod shape-determining protein MreC  34.97 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  26.47 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  31.84 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  31.91 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  27.62 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  30.05 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  32.39 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  32.39 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  28.05 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  30.9 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  29.94 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  28.71 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  27.23 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  28.77 
 
 		 367 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  30.39 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  28.07 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  31.34 
 
 		 316 aa  75.5  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  28.9 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  29.03 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  31.36 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  27.69 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  28.07 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  35.83 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  23.59 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  30.54 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  30.54 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  29.06 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  34.43 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  28.82 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  26.89 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  28.82 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  26.89 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  26.89 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  26.89 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  30.89 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  32.75 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  31.18 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  27.39 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  27.83 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  27.83 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  30.59 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  28.97 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  26.29 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 357 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  31.72 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  29.31 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  23.94 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  27.78 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  28.65 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>