262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1413 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1413  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 307 aa  600  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0196901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  31.65 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  32.23 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  34.36 
 
 		 274 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  32.54 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  34.78 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  35.57 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  34.17 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  36.13 
 
 		 338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  32.34 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  36.08 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  33.5 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  31.75 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  31.74 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  37.67 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  32.17 
 
 		 272 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  32.49 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  29.18 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  30.51 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  32.42 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  37.21 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  29.67 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  30.6 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  36.62 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  32.91 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  34.27 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  29.63 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  31.39 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  31.05 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  30.38 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  29.61 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  36.32 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  32.77 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  30.47 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  34.48 
 
 		 414 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  28.69 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 		 348 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  32.35 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  31.76 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  32.35 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  29.33 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  32.35 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  29.87 
 
 		 277 aa  99.4  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  32.51 
 
 		 296 aa  99  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  35.89 
 
 		 291 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  31.84 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  31.75 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  32.62 
 
 		 369 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  31.93 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  31.09 
 
 		 356 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  28.4 
 
 		 333 aa  97.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  31.09 
 
 		 356 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  33.65 
 
 		 369 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  31.48 
 
 		 367 aa  96.3  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  34.56 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  31.98 
 
 		 367 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  31.42 
 
 		 279 aa  95.9  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  31.42 
 
 		 279 aa  95.9  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  31.49 
 
 		 359 aa  95.9  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  31.06 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  31.06 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  31.06 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  29.21 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  31.06 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  31.06 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  31.06 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  28.46 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  31.06 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  28.64 
 
 		 357 aa  94.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  34.06 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  25.09 
 
 		 283 aa  93.6  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  28.79 
 
 		 281 aa  93.2  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  38.14 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 		 286 aa  92.8  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  28.08 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  29.46 
 
 		 315 aa  92.4  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  30.35 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  33.49 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  33.49 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  24.36 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  32.24 
 
 		 356 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  33.49 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  27.69 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  24 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  34.21 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  33.82 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  27.39 
 
 		 334 aa  90.5  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  29.62 
 
 		 306 aa  89.7  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 		 275 aa  90.1  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 		 291 aa  89.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>