286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0593 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
277 aa  559  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  38.69 
 
 
274 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  41.01 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  42.17 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  40.79 
 
 
274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  41.99 
 
 
281 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  42.17 
 
 
273 aa  162  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  37.65 
 
 
274 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  33.92 
 
 
286 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  34.12 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  39.74 
 
 
274 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  38.81 
 
 
274 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  34.02 
 
 
317 aa  142  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  36.97 
 
 
291 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  36.55 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  36.13 
 
 
291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 
288 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  30.15 
 
 
285 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  36.82 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  38.94 
 
 
273 aa  133  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  31.67 
 
 
359 aa  132  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  30.86 
 
 
287 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  32.22 
 
 
276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  29.37 
 
 
271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  31.14 
 
 
357 aa  129  6e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  35.37 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  32.14 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  31.72 
 
 
283 aa  125  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  35.85 
 
 
283 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  30.86 
 
 
277 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  30.34 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  35.35 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  32.2 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 
304 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  29.14 
 
 
288 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  32 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  30.49 
 
 
338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  31.47 
 
 
296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
285 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 
285 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  29.7 
 
 
257 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  32.52 
 
 
296 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  32.16 
 
 
348 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  28.95 
 
 
348 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  26.04 
 
 
285 aa  103  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  31.16 
 
 
346 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  28.95 
 
 
287 aa  102  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  29.45 
 
 
318 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  28.89 
 
 
292 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  27.07 
 
 
324 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  29.08 
 
 
300 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  31.35 
 
 
315 aa  100  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  27.44 
 
 
336 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  25.36 
 
 
283 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  25.36 
 
 
283 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  29.78 
 
 
299 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  31.16 
 
 
243 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 
292 aa  99.4  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  26.47 
 
 
286 aa  99.4  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  30.71 
 
 
330 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  30.9 
 
 
329 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 
288 aa  99  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  34.12 
 
 
334 aa  98.6  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  35.5 
 
 
312 aa  97.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 
296 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  26.45 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  32.32 
 
 
249 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  32.32 
 
 
249 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  31.4 
 
 
302 aa  96.7  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  33.94 
 
 
256 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  30.74 
 
 
317 aa  96.3  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  27.7 
 
 
286 aa  96.3  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  32.7 
 
 
306 aa  95.5  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  30.23 
 
 
311 aa  95.9  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  30.18 
 
 
288 aa  95.5  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  25.91 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  25.91 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  24.64 
 
 
285 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  32.22 
 
 
309 aa  94.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  26.28 
 
 
283 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  28.46 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  29.24 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  28.91 
 
 
306 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  25.91 
 
 
283 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  26.26 
 
 
281 aa  93.6  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  28.92 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  33.01 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  31.47 
 
 
357 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  29.05 
 
 
326 aa  93.2  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  28.03 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  31.47 
 
 
359 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  30.88 
 
 
332 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  33.14 
 
 
362 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  25.55 
 
 
283 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  30.88 
 
 
330 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  31.12 
 
 
369 aa  92  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  27.85 
 
 
285 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  28.04 
 
 
331 aa  91.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  29.67 
 
 
283 aa  92  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 
328 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>