246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1350 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 287 aa  580  1.0000000000000001e-165  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  30.17 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  28.46 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  29.04 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  30.4 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  28.9 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  26.59 
 
 		 274 aa  96.3  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  28.89 
 
 		 272 aa  92.4  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  32.1 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  27.54 
 
 		 317 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  26.35 
 
 		 288 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  27.39 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  28.38 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  28.31 
 
 		 274 aa  85.9  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  25.27 
 
 		 288 aa  85.9  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  29.72 
 
 		 283 aa  85.5  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  29.8 
 
 		 288 aa  85.5  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  27.34 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  26.95 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  31.6 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  23.81 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  24.36 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  29.33 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  28.33 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  25.64 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  29.84 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  25.96 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  28.85 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  26.57 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  29.17 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  26.57 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  31.85 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1380  rod shape-determining protein MreC  23.22 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  23.01 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  29.26 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1282  rod shape-determining protein MreC  26.12 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  26.1 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  29.88 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  29.23 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  29.32 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  29.32 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  28.34 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  24.12 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  25.81 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  28.71 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  26.7 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  26.53 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  28.07 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  25.2 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1671  rod shape-determining protein MreC  27.83 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575744 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  24 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  27.93 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1190  rod shape-determining protein MreC  25.2 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.759069  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  24.17 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  25.31 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  24.8 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  24.51 
 
 		 334 aa  67  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  23.41 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  27.83 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  24.8 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  23.72 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0711  rod shape-determining protein MreC  23.49 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  27.32 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  25.62 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  25.75 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  21.9 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0193  rod shape-determining protein MreC  25.1 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  23.83 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  23.83 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  22.97 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  29.08 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1686  rod shape-determining protein MreC  25.9 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00570  rod shape-determining protein  28.57 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119359  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  23.19 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  22.97 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  23.19 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  25.71 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  31.17 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  25.77 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  24.76 
 
 		 381 aa  62.4  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1457  rod shape-determining protein MreC  27.62 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  25.27 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  24.72 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  28.76 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  26.11 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  22.1 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  24.66 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  24.77 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  25.11 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>