287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2494 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
274 aa  554  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  60.53 
 
 
272 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  60.22 
 
 
274 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  56.2 
 
 
274 aa  304  9.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  58.61 
 
 
273 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  51.09 
 
 
274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  52.01 
 
 
274 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  43.49 
 
 
272 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  41.01 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  35.74 
 
 
281 aa  172  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  34.69 
 
 
291 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  36.32 
 
 
357 aa  137  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  35.36 
 
 
286 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  38.86 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  38.39 
 
 
291 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  38.39 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  33.21 
 
 
296 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  30.74 
 
 
317 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  36.45 
 
 
315 aa  122  5e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  29.77 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  30.43 
 
 
359 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  34.9 
 
 
273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  33.7 
 
 
292 aa  118  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  32.08 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  32.58 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  30.27 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  34.29 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  38.24 
 
 
302 aa  112  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  30.3 
 
 
271 aa  112  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  30.31 
 
 
285 aa  112  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  30.71 
 
 
292 aa  112  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  31.73 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 
288 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  31.75 
 
 
338 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  29.17 
 
 
288 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 
306 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  29.67 
 
 
304 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 
296 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  26.77 
 
 
283 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  32.73 
 
 
279 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  32.73 
 
 
279 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  29.95 
 
 
286 aa  105  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 
286 aa  105  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  34.76 
 
 
276 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  31.27 
 
 
288 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  30.57 
 
 
326 aa  105  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  34.13 
 
 
348 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  35.15 
 
 
274 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  33.49 
 
 
286 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  30.88 
 
 
286 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  33.65 
 
 
348 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  32.39 
 
 
304 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  37.93 
 
 
249 aa  102  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  28.95 
 
 
286 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 
305 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  33.84 
 
 
286 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  33.65 
 
 
346 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  32.83 
 
 
296 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 
249 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 
249 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  35.63 
 
 
306 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  32.67 
 
 
254 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  32.54 
 
 
257 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  34.59 
 
 
331 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  34.59 
 
 
331 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  29.64 
 
 
305 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  34.59 
 
 
331 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  31.47 
 
 
367 aa  99.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  29.59 
 
 
277 aa  99.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  27.07 
 
 
311 aa  99.8  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  31.47 
 
 
355 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  30.84 
 
 
317 aa  99.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  33.52 
 
 
251 aa  99.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  29.91 
 
 
291 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  32.09 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  31.71 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  30.17 
 
 
358 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  30.56 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  29.13 
 
 
334 aa  97.8  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  30.17 
 
 
358 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1413  rod shape-determining protein MreC  33.5 
 
 
307 aa  97.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0196901  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  35 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  30.17 
 
 
356 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  30.17 
 
 
358 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  30.17 
 
 
356 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  30.6 
 
 
367 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  32.32 
 
 
359 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  31.5 
 
 
414 aa  96.7  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  32.77 
 
 
309 aa  96.3  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  28.9 
 
 
287 aa  96.3  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  30.6 
 
 
369 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  29.74 
 
 
288 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  37.04 
 
 
381 aa  96.3  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  32.32 
 
 
357 aa  95.9  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  32.32 
 
 
357 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  32.32 
 
 
357 aa  95.9  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  32.32 
 
 
357 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  32.32 
 
 
357 aa  95.9  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>