277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1640 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  35.85 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  36.03 
 
 
286 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  36.79 
 
 
285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  36.92 
 
 
317 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  35.25 
 
 
274 aa  151  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  32.25 
 
 
277 aa  136  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  33.09 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  37.6 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  29.59 
 
 
283 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  29.93 
 
 
288 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 
283 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  30.07 
 
 
283 aa  125  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  28.67 
 
 
283 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  28.67 
 
 
283 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  30.15 
 
 
288 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  29.37 
 
 
283 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  29.76 
 
 
283 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  29.02 
 
 
283 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  33.6 
 
 
273 aa  122  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  29.39 
 
 
283 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  29.76 
 
 
283 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  29.27 
 
 
285 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  32.2 
 
 
277 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  38.68 
 
 
288 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  29.89 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  28.88 
 
 
287 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  32.72 
 
 
357 aa  113  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  29.97 
 
 
285 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  31.45 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  29.17 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  29.66 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  30.63 
 
 
274 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 
274 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  31.23 
 
 
302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
288 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  36.55 
 
 
315 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  30.2 
 
 
273 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  32.6 
 
 
276 aa  105  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  32 
 
 
274 aa  105  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  28.28 
 
 
281 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  28.69 
 
 
291 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  29.62 
 
 
299 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 
296 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  29.82 
 
 
272 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  30.84 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  27.62 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  31.88 
 
 
359 aa  97.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  31.44 
 
 
333 aa  96.7  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 
267 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  27.95 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  29.39 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  28.31 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  27.6 
 
 
274 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  27.23 
 
 
291 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  33.49 
 
 
286 aa  92.4  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  26.24 
 
 
292 aa  92.4  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  29.58 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  35.8 
 
 
251 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  30.24 
 
 
257 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  35.14 
 
 
251 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  31.67 
 
 
243 aa  89.7  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5926  Rod shape-determining protein MreC  26.11 
 
 
278 aa  89.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  32.16 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  29.19 
 
 
285 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  30.39 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  30.97 
 
 
255 aa  85.9  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  27.31 
 
 
296 aa  85.9  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  30.61 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0711  rod shape-determining protein MreC  25.37 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  31.82 
 
 
282 aa  85.5  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  30.65 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  28.08 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  33 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  28.09 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  30.17 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0866  rod shape-determining protein MreC  28.82 
 
 
280 aa  84  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0150  rod shape-determining protein MreC  37.18 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  30.15 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  26.48 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  32.04 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  26.39 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  35.9 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  27.34 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2603  Rod shape-determining protein MreC  30.88 
 
 
263 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  27.34 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  31.51 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  32.18 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1212  rod shape-determining protein MreC  24.91 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3307  rod shape-determining protein MreC  29.21 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.198941  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  32.04 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0286  rod shape-determining protein MreC  29.91 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  26.69 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  26.69 
 
 
302 aa  79.7  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  32.12 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  26.97 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  27.18 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  24.64 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  32.02 
 
 
316 aa  79  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  27.07 
 
 
356 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>