277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0163 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 296 aa  587  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  50.37 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  45.65 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  44.44 
 
 		 338 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  45.49 
 
 		 283 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  51.11 
 
 		 319 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  33.08 
 
 		 274 aa  136  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  34.66 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  32.58 
 
 		 274 aa  123  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  30.4 
 
 		 277 aa  123  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  31.71 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  34.6 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  30.5 
 
 		 272 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  31.73 
 
 		 296 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  38.28 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  32.95 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  34.11 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  29.13 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  35 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 		 281 aa  105  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  28.88 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  32.58 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 		 296 aa  99.8  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  29.66 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  31.18 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  34.74 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  26.59 
 
 		 283 aa  96.3  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  29.06 
 
 		 296 aa  95.9  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  30.6 
 
 		 309 aa  95.9  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  26.59 
 
 		 283 aa  95.5  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  28.85 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  29.06 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  34.27 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  33.8 
 
 		 291 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  33.18 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  29.1 
 
 		 369 aa  92.8  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  28.91 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  29.17 
 
 		 331 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  29.17 
 
 		 331 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  29.17 
 
 		 331 aa  90.1  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  30.23 
 
 		 414 aa  90.1  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  28.23 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  30.5 
 
 		 333 aa  89.4  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  29.7 
 
 		 334 aa  89.4  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  28.97 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  28.36 
 
 		 369 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  28.45 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  27.01 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1413  rod shape-determining protein MreC  34.2 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0196901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  28.9 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  28.36 
 
 		 351 aa  87  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  31.34 
 
 		 286 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  26.94 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  29.66 
 
 		 293 aa  86.3  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  28.07 
 
 		 346 aa  85.5  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  28.36 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  26.57 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  27.61 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3737  rod shape-determining protein MreC  31.2 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00218266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  26.24 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  31.32 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  29.59 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  28.62 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  32.49 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  30.8 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  29.6 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  27.6 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  26.6 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  28.69 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  28.9 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3834  rod shape-determining protein MreC  28.98 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0283563  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  23.67 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  29.74 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  27.07 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  29.31 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  28.43 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  31.19 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  32 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  29.63 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3753  rod shape-determining protein MreC  31.48 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000670381  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  29.55 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0480  rod shape-determining protein MreC  28.62 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.589731  normal  0.326651 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  31.4 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3471  rod shape-determining protein MreC  29.47 
 
 		 353 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0021778  normal  0.815632 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  26.2 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  26.2 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  26.2 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  26.2 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  26.2 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  26.2 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  30.18 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  26.2 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  23.91 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  30.11 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  26.25 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0253  rod shape-determining protein MreC  29.39 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00109654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3647  rod shape-determining protein MreC  31.94 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0178406  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>