284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0671 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 357 aa  714    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  43.2 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  37.93 
 
 		 292 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  37.18 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  41.12 
 
 		 273 aa  145  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  36.21 
 
 		 274 aa  143  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  39.61 
 
 		 274 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  38.29 
 
 		 272 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  36.32 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  36.91 
 
 		 274 aa  135  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  34.67 
 
 		 359 aa  133  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  30.08 
 
 		 281 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  31.14 
 
 		 277 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  33.07 
 
 		 272 aa  126  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  35.27 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  27.13 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  32.31 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  32.31 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  30.63 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  30.57 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  30.57 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  30.57 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  30.57 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  30.57 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  30.57 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  30.57 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  28.98 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  29.1 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  31.6 
 
 		 317 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  28.1 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  33.01 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  32.31 
 
 		 271 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  28.46 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  31.32 
 
 		 367 aa  117  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  29.81 
 
 		 359 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  29 
 
 		 324 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  32.51 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  29.81 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  28.84 
 
 		 336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  29.81 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  29.45 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  29.81 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  26.1 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  28.84 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  29.06 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  29.43 
 
 		 356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  29.43 
 
 		 356 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  30.94 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  30.94 
 
 		 283 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  31.1 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  30.94 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  28.01 
 
 		 356 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  26.52 
 
 		 312 aa  109  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  30.97 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  27.53 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  28.71 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  27.57 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  27.9 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  28.62 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  27.92 
 
 		 283 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  28.22 
 
 		 348 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  26.02 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  27.17 
 
 		 369 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  30.93 
 
 		 288 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  28.22 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  27.11 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  32.2 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  25.19 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  34.03 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  36.33 
 
 		 274 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  27.21 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  31.05 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  31.05 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  31.05 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  25.87 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  28.68 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  28.79 
 
 		 294 aa  103  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  27.34 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  28.24 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  25.08 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  26.79 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  25.26 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  27.69 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  27.31 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  29.49 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  29.79 
 
 		 283 aa  100  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  26.92 
 
 		 305 aa  100  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  25.53 
 
 		 362 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  27.17 
 
 		 310 aa  99.8  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  24.62 
 
 		 334 aa  99.4  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  33.03 
 
 		 274 aa  99.4  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  30.38 
 
 		 288 aa  99.4  1e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  27.13 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  26.79 
 
 		 282 aa  98.2  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  37.34 
 
 		 249 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  37.34 
 
 		 249 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>