255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3166 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  99.16 
 
 		 356 aa  694    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 356 aa  701    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  93.4 
 
 		 358 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  93.4 
 
 		 358 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  93.08 
 
 		 358 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  93.86 
 
 		 355 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  93.4 
 
 		 367 aa  544  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  82.07 
 
 		 359 aa  488  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  77.12 
 
 		 357 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  77.12 
 
 		 357 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  77.12 
 
 		 357 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  77.12 
 
 		 357 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  77.12 
 
 		 357 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  77.12 
 
 		 357 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  77.12 
 
 		 357 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  69.64 
 
 		 369 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  78.2 
 
 		 367 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  79.3 
 
 		 369 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  52.69 
 
 		 336 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  55.32 
 
 		 324 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  47.35 
 
 		 307 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  50.54 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  50.18 
 
 		 348 aa  265  8e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  46.37 
 
 		 346 aa  260  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  49.09 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  45.33 
 
 		 306 aa  256  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  42.18 
 
 		 311 aa  249  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  46.38 
 
 		 305 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  46.01 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  46.13 
 
 		 292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  45.51 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  46.74 
 
 		 356 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  44 
 
 		 306 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  40.39 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  44.52 
 
 		 311 aa  228  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  43.24 
 
 		 312 aa  226  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1609  rod shape-determining protein MreC  44.77 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.72705  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  39.27 
 
 		 281 aa  209  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  39.93 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  39.85 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  36.01 
 
 		 291 aa  174  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  33.76 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  37.08 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  35.96 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  36.4 
 
 		 296 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  35.54 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  33.12 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  35.71 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  32.67 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  35.8 
 
 		 281 aa  153  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  36.7 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  34.89 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  35.53 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  35.66 
 
 		 331 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  35.66 
 
 		 331 aa  149  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  35.66 
 
 		 331 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  35 
 
 		 362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  32.96 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  35.21 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  34.57 
 
 		 286 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  34.75 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  36.33 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  32.46 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  32.67 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  32.85 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  32.62 
 
 		 357 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  33.71 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  33.22 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  34.03 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  33.45 
 
 		 281 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  31.8 
 
 		 286 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3281  rod shape-determining protein MreC  31.86 
 
 		 361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000057378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0498  rod shape-determining protein MreC  33.73 
 
 		 336 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000920661  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  33.73 
 
 		 336 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  33.73 
 
 		 336 aa  135  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3737  rod shape-determining protein MreC  35.58 
 
 		 320 aa  135  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00218266  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  33.53 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03109  cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreC  34.75 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0024282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0457  rod shape-determining protein MreC  34.75 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000354374  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4566  rod shape-determining protein MreC  34.75 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000293229  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3545  rod shape-determining protein MreC  34.75 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000398804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  34.78 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3733  rod shape-determining protein MreC  34.75 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011451  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0457  rod shape-determining protein MreC  34.75 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00301189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  33.1 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03060  hypothetical protein  34.75 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00317154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3439  rod shape-determining protein MreC  34.75 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626675  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  36.7 
 
 		 298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4097  rod shape-determining protein MreC  32.49 
 
 		 355 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  29.78 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  36.7 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4410  rod shape-determining protein MreC  35.52 
 
 		 334 aa  130  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000283267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3647  rod shape-determining protein MreC  33.03 
 
 		 353 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0178406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  34.38 
 
 		 243 aa  129  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3565  rod shape-determining protein MreC  34.36 
 
 		 350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.145579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3636  rod shape-determining protein MreC  34.36 
 
 		 350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0150726  hitchhiker  0.00366072 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3671  rod shape-determining protein MreC  34.36 
 
 		 350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208863  normal  0.389982 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3733  rod shape-determining protein MreC  34.36 
 
 		 350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0325244  normal  0.0423358 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3834  rod shape-determining protein MreC  32.86 
 
 		 383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0283563  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3564  rod shape-determining protein MreC  34.36 
 
 		 350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00821336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>