272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0237 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
292 aa  577  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  48.95 
 
 
311 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  48.42 
 
 
367 aa  262  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  48.07 
 
 
369 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  48.77 
 
 
369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  46.9 
 
 
355 aa  255  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  46.55 
 
 
358 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  46.55 
 
 
358 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  46.55 
 
 
358 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  46.15 
 
 
336 aa  248  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  46.5 
 
 
367 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  45.52 
 
 
324 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  45.2 
 
 
357 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  45.2 
 
 
357 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  45.2 
 
 
357 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  45.2 
 
 
357 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  45.2 
 
 
357 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  45.2 
 
 
357 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  45.2 
 
 
357 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  46.13 
 
 
356 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  46.13 
 
 
356 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  45.61 
 
 
307 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  44.25 
 
 
359 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  45.02 
 
 
306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  48.9 
 
 
306 aa  232  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  42.37 
 
 
356 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  45.56 
 
 
326 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  44.28 
 
 
348 aa  221  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  44.07 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  44.28 
 
 
348 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  45.02 
 
 
305 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  45.96 
 
 
298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  44.65 
 
 
305 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  44.57 
 
 
310 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  43.93 
 
 
346 aa  203  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1609  rod shape-determining protein MreC  44.75 
 
 
311 aa  195  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.72705  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  41.3 
 
 
311 aa  192  8e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  39.13 
 
 
312 aa  188  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  33.95 
 
 
311 aa  186  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  38.95 
 
 
309 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  38.03 
 
 
317 aa  175  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  42.32 
 
 
294 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  41.2 
 
 
334 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  39.7 
 
 
300 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  38.73 
 
 
293 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  34.02 
 
 
281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  38.61 
 
 
286 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  42.55 
 
 
336 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0498  rod shape-determining protein MreC  42.55 
 
 
336 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000920661  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  42.55 
 
 
338 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  42.55 
 
 
336 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  37.45 
 
 
328 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  39.85 
 
 
292 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  37.5 
 
 
362 aa  156  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3471  rod shape-determining protein MreC  40.73 
 
 
353 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0021778  normal  0.815632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0480  rod shape-determining protein MreC  40.73 
 
 
353 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.589731  normal  0.326651 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3737  rod shape-determining protein MreC  40.67 
 
 
320 aa  156  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00218266  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  36.72 
 
 
318 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  36.7 
 
 
299 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3647  rod shape-determining protein MreC  40.36 
 
 
353 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0178406  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  38.22 
 
 
281 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  37.55 
 
 
359 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  37.55 
 
 
357 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  39.33 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  36.78 
 
 
329 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4097  rod shape-determining protein MreC  39.27 
 
 
355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  36.54 
 
 
330 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  35.96 
 
 
296 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  35.14 
 
 
267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  33.45 
 
 
291 aa  146  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3753  rod shape-determining protein MreC  41.54 
 
 
295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000670381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  35 
 
 
414 aa  146  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  35.16 
 
 
331 aa  145  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  39.22 
 
 
298 aa  145  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  35.16 
 
 
331 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  35.16 
 
 
331 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  38.28 
 
 
310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  36.55 
 
 
325 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  39.33 
 
 
298 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  36.14 
 
 
332 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  36.14 
 
 
330 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  37.29 
 
 
254 aa  142  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  36.48 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  34.21 
 
 
292 aa  140  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  34.12 
 
 
286 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  34.46 
 
 
296 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  34.21 
 
 
292 aa  138  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  34.59 
 
 
326 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  35.61 
 
 
316 aa  136  4e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  35.58 
 
 
351 aa  136  5e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4410  rod shape-determining protein MreC  36.19 
 
 
334 aa  135  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000283267  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  34.87 
 
 
277 aa  135  9e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  34.93 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  38.15 
 
 
448 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0457  rod shape-determining protein MreC  34.63 
 
 
367 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00301189  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  36.48 
 
 
407 aa  132  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  37.67 
 
 
243 aa  132  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0457  rod shape-determining protein MreC  34.24 
 
 
367 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000354374  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3281  rod shape-determining protein MreC  34.24 
 
 
361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000057378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3733  rod shape-determining protein MreC  34.24 
 
 
367 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>