258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4471 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 359 aa  719    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  94.15 
 
 		 357 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  77.52 
 
 		 362 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  90.48 
 
 		 332 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  90.81 
 
 		 325 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  90.44 
 
 		 330 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  90.26 
 
 		 333 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  79.35 
 
 		 330 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  78.99 
 
 		 329 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  81.75 
 
 		 318 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  81 
 
 		 328 aa  441  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  54.95 
 
 		 254 aa  253  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  52.81 
 
 		 243 aa  249  7e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  45.06 
 
 		 267 aa  239  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  47.1 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  46.46 
 
 		 317 aa  232  9e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  44 
 
 		 281 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  45.82 
 
 		 334 aa  223  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  45.35 
 
 		 309 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  40.79 
 
 		 299 aa  219  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  44.36 
 
 		 294 aa  215  9e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  47.69 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0498  rod shape-determining protein MreC  45.82 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000920661  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  39.64 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  45.82 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  45.82 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  45.82 
 
 		 336 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  44.12 
 
 		 286 aa  210  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  34.56 
 
 		 414 aa  209  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  45.14 
 
 		 292 aa  209  9e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3737  rod shape-determining protein MreC  44.36 
 
 		 320 aa  205  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00218266  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  38.62 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3753  rod shape-determining protein MreC  45.85 
 
 		 295 aa  204  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000670381  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3471  rod shape-determining protein MreC  44.62 
 
 		 353 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0021778  normal  0.815632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0480  rod shape-determining protein MreC  44.62 
 
 		 353 aa  203  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.589731  normal  0.326651 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3647  rod shape-determining protein MreC  44.62 
 
 		 353 aa  202  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0178406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  43.53 
 
 		 300 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  43.91 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4097  rod shape-determining protein MreC  39.03 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  42.68 
 
 		 277 aa  199  9e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  41.35 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  39.68 
 
 		 285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  45.85 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  40.24 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  36.72 
 
 		 291 aa  192  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  39.84 
 
 		 292 aa  192  8e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  39.55 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  39.29 
 
 		 351 aa  185  9e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  38.08 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  38.08 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  38.08 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  40.16 
 
 		 448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  40.47 
 
 		 302 aa  182  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  40.47 
 
 		 302 aa  182  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3281  rod shape-determining protein MreC  36.31 
 
 		 361 aa  179  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000057378  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  39.13 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3834  rod shape-determining protein MreC  35.67 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0283563  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  40 
 
 		 316 aa  176  8e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03109  cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreC  40.16 
 
 		 367 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0024282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0457  rod shape-determining protein MreC  40.16 
 
 		 367 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000354374  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0457  rod shape-determining protein MreC  40.16 
 
 		 367 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00301189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03060  hypothetical protein  40.16 
 
 		 367 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00317154  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3545  rod shape-determining protein MreC  40.16 
 
 		 367 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000398804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3733  rod shape-determining protein MreC  40.16 
 
 		 367 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011451  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3439  rod shape-determining protein MreC  40.16 
 
 		 367 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4566  rod shape-determining protein MreC  40.16 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000293229  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  39.6 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3636  rod shape-determining protein MreC  36.8 
 
 		 350 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0150726  hitchhiker  0.00366072 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3565  rod shape-determining protein MreC  36.8 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.145579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3564  rod shape-determining protein MreC  36.8 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00821336  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3733  rod shape-determining protein MreC  36.8 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0325244  normal  0.0423358 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3671  rod shape-determining protein MreC  36.8 
 
 		 350 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208863  normal  0.389982 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  38.11 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4410  rod shape-determining protein MreC  37.5 
 
 		 334 aa  170  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000283267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  34.78 
 
 		 336 aa  169  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3686  rod shape-determining protein MreC  39.34 
 
 		 338 aa  169  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000135967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  38.74 
 
 		 298 aa  168  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0253  rod shape-determining protein MreC  38.1 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00109654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0264  rod shape-determining protein MreC  36.63 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.032676  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  35.25 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  37.69 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  35.55 
 
 		 311 aa  159  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  37.19 
 
 		 348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  35.94 
 
 		 326 aa  156  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  36.78 
 
 		 348 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  33.86 
 
 		 286 aa  155  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  36.51 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  34.25 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  34.16 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  35.43 
 
 		 282 aa  152  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  37.55 
 
 		 292 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  35.77 
 
 		 281 aa  152  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  35.18 
 
 		 369 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 		 367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  37.24 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  35.57 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  33.73 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  35.97 
 
 		 355 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  34.23 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  34.78 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>