262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0284 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 326 aa  650    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  64.82 
 
 		 307 aa  401  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  62.9 
 
 		 306 aa  374  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  62.58 
 
 		 306 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  60.33 
 
 		 306 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  61.27 
 
 		 305 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  60.56 
 
 		 305 aa  352  4e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  57.33 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  55.85 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1609  rod shape-determining protein MreC  60.7 
 
 		 311 aa  303  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.72705  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  54.7 
 
 		 312 aa  297  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  47.08 
 
 		 336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  49.66 
 
 		 355 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  49.32 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  49.32 
 
 		 358 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  49.32 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  50.55 
 
 		 324 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  49.45 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  49.09 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  49.09 
 
 		 356 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  49.28 
 
 		 357 aa  255  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  49.28 
 
 		 357 aa  255  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  49.28 
 
 		 357 aa  255  7e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  49.28 
 
 		 357 aa  255  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  49.28 
 
 		 357 aa  255  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  46.18 
 
 		 369 aa  255  7e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  49.28 
 
 		 357 aa  255  7e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  49.28 
 
 		 357 aa  255  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  46.18 
 
 		 369 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  48.91 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  45.49 
 
 		 367 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  48.36 
 
 		 348 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  48.36 
 
 		 348 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  41.03 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  45.39 
 
 		 292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  46 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  39.14 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  38.49 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  39 
 
 		 298 aa  193  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  34.48 
 
 		 328 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  36.95 
 
 		 281 aa  169  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  35.02 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  34.9 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  35.91 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  37.5 
 
 		 286 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  35.14 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  34.24 
 
 		 359 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  34.24 
 
 		 357 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  33.82 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  36.88 
 
 		 281 aa  159  9e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  36.68 
 
 		 318 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  35.14 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  35.06 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  33.79 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  33.57 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  34.81 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  33.56 
 
 		 332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  33.56 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  35.79 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  32.1 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  34.94 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  35.09 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  30.51 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  32.61 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  29.73 
 
 		 267 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3737  rod shape-determining protein MreC  35.06 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00218266  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0480  rod shape-determining protein MreC  34.74 
 
 		 353 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.589731  normal  0.326651 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  35.27 
 
 		 286 aa  135  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  35.36 
 
 		 281 aa  135  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  35.54 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0498  rod shape-determining protein MreC  35.54 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000920661  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  35.54 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  35.54 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3471  rod shape-determining protein MreC  34.77 
 
 		 353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0021778  normal  0.815632 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  36.19 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3647  rod shape-determining protein MreC  34.42 
 
 		 353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0178406  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4097  rod shape-determining protein MreC  33.77 
 
 		 355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  35.88 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  35.64 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  34.32 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  30.52 
 
 		 351 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  33.48 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  31.92 
 
 		 331 aa  126  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  31.92 
 
 		 331 aa  126  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  31.92 
 
 		 331 aa  126  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  30.15 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  31.7 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  31.73 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3753  rod shape-determining protein MreC  34.28 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000670381  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  31.37 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3834  rod shape-determining protein MreC  32.1 
 
 		 383 aa  119  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0283563  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  32.96 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0457  rod shape-determining protein MreC  31.54 
 
 		 367 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00301189  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0457  rod shape-determining protein MreC  31.54 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000354374  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03060  hypothetical protein  31.54 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00317154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3281  rod shape-determining protein MreC  31.54 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000057378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3733  rod shape-determining protein MreC  31.54 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011451  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3545  rod shape-determining protein MreC  31.54 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000398804  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>