272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0060 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 346 aa  677    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  91.09 
 
 		 348 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  91.09 
 
 		 348 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  71.89 
 
 		 324 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  63.1 
 
 		 336 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  53.74 
 
 		 369 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  52.31 
 
 		 369 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  51.96 
 
 		 367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  49.65 
 
 		 357 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  49.65 
 
 		 357 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  49.65 
 
 		 357 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  49.65 
 
 		 357 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  50.53 
 
 		 355 aa  289  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  49.65 
 
 		 357 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  49.65 
 
 		 357 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  49.65 
 
 		 357 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  50.9 
 
 		 356 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  50.9 
 
 		 356 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  49.47 
 
 		 358 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  49.47 
 
 		 358 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  49.47 
 
 		 358 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  49.47 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  50.35 
 
 		 367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  47.21 
 
 		 307 aa  256  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  43.42 
 
 		 311 aa  248  8e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  48.76 
 
 		 356 aa  245  6.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  45.08 
 
 		 306 aa  245  9e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  46.74 
 
 		 306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  47.64 
 
 		 326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  46.79 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  46.43 
 
 		 305 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  45.88 
 
 		 306 aa  236  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  44.28 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  43.77 
 
 		 312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  41.49 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  42.28 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  45.94 
 
 		 311 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  42.86 
 
 		 310 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1609  rod shape-determining protein MreC  45.07 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.72705  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  41.11 
 
 		 281 aa  203  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  32.87 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  35.13 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  36.3 
 
 		 317 aa  175  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  39.06 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  34.83 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  34.83 
 
 		 296 aa  169  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  38.1 
 
 		 359 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  37.7 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  37.5 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  39.85 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  34.08 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  37.11 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  36.9 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  36.29 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  36.02 
 
 		 329 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  36.86 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  34.52 
 
 		 334 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  36.25 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  37.17 
 
 		 300 aa  160  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  36.55 
 
 		 330 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  36.14 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  36.02 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  34.81 
 
 		 294 aa  157  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  33.71 
 
 		 285 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  37.14 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  35.66 
 
 		 333 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  33.59 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  33.59 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  33.59 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  33.46 
 
 		 326 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  31.84 
 
 		 414 aa  149  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  28.22 
 
 		 351 aa  149  9e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  35.77 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  34.83 
 
 		 316 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  36.47 
 
 		 281 aa  146  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  38.01 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  32.33 
 
 		 292 aa  146  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  32.31 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3647  rod shape-determining protein MreC  35.2 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0178406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  32.33 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0498  rod shape-determining protein MreC  37.27 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000920661  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  37.27 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  37.27 
 
 		 336 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  36.32 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  37.27 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3281  rod shape-determining protein MreC  33.46 
 
 		 361 aa  142  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000057378  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03109  cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreC  33.46 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0024282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0457  rod shape-determining protein MreC  33.46 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000354374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3439  rod shape-determining protein MreC  33.46 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4566  rod shape-determining protein MreC  33.46 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000293229  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3545  rod shape-determining protein MreC  33.46 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000398804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3733  rod shape-determining protein MreC  33.46 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011451  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03060  hypothetical protein  33.46 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00317154  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0457  rod shape-determining protein MreC  33.46 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00301189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3564  rod shape-determining protein MreC  33.07 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00821336  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3733  rod shape-determining protein MreC  33.07 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0325244  normal  0.0423358 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3671  rod shape-determining protein MreC  33.07 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208863  normal  0.389982 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  29.62 
 
 		 267 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3565  rod shape-determining protein MreC  33.07 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.145579  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>