257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0513 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 286 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  55.16 
 
 		 292 aa  278  6e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  46.12 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  48.34 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  45.07 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  43.08 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  43.08 
 
 		 329 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  42.55 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  43.16 
 
 		 293 aa  209  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  42.32 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  41.8 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  41.35 
 
 		 359 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  41.35 
 
 		 357 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  41.18 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  41.18 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  39.69 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  39.84 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  40.86 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  42.97 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  39.77 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  39 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  39.01 
 
 		 325 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  41.2 
 
 		 332 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  41.37 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  41.47 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  44.91 
 
 		 254 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  39.68 
 
 		 292 aa  188  9e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  40.98 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  39.68 
 
 		 292 aa  185  6e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  39.16 
 
 		 334 aa  185  7e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  41.06 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  40.54 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  40.59 
 
 		 277 aa  182  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  42.25 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  41.86 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  41.7 
 
 		 298 aa  176  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  42.08 
 
 		 298 aa  175  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  38.61 
 
 		 336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  42.56 
 
 		 448 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3737  rod shape-determining protein MreC  41.31 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00218266  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0498  rod shape-determining protein MreC  38.61 
 
 		 336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000920661  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  42.08 
 
 		 338 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  36.3 
 
 		 298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  38.61 
 
 		 336 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  37.88 
 
 		 414 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  40.47 
 
 		 326 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  41.96 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3647  rod shape-determining protein MreC  39.51 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0178406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  40.28 
 
 		 243 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3471  rod shape-determining protein MreC  39.16 
 
 		 353 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0021778  normal  0.815632 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  35.38 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0480  rod shape-determining protein MreC  39.16 
 
 		 353 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.589731  normal  0.326651 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4097  rod shape-determining protein MreC  38.46 
 
 		 355 aa  169  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3753  rod shape-determining protein MreC  39.86 
 
 		 295 aa  165  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000670381  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  38.61 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  37.17 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  37.13 
 
 		 310 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  35.69 
 
 		 336 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  38.46 
 
 		 351 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  35.64 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  36.8 
 
 		 369 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  37.8 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  37.83 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  36.99 
 
 		 348 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  35.64 
 
 		 306 aa  158  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  36.17 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  36.23 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0457  rod shape-determining protein MreC  39.43 
 
 		 367 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00301189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3281  rod shape-determining protein MreC  39.43 
 
 		 361 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000057378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  37.4 
 
 		 331 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  37.4 
 
 		 331 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  37.4 
 
 		 331 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4566  rod shape-determining protein MreC  39.43 
 
 		 367 aa  155  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000293229  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3733  rod shape-determining protein MreC  39.43 
 
 		 367 aa  155  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011451  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03109  cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreC  39.43 
 
 		 367 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0024282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0457  rod shape-determining protein MreC  39.43 
 
 		 367 aa  155  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000354374  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  36.88 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3545  rod shape-determining protein MreC  39.43 
 
 		 367 aa  155  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000398804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03060  hypothetical protein  39.43 
 
 		 367 aa  155  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00317154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3439  rod shape-determining protein MreC  39.43 
 
 		 367 aa  155  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626675  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3834  rod shape-determining protein MreC  38.26 
 
 		 383 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0283563  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  36.6 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3636  rod shape-determining protein MreC  39.43 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0150726  hitchhiker  0.00366072 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3733  rod shape-determining protein MreC  39.43 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0325244  normal  0.0423358 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3565  rod shape-determining protein MreC  39.43 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.145579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3564  rod shape-determining protein MreC  39.43 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00821336  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  35.32 
 
 		 367 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3671  rod shape-determining protein MreC  39.43 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208863  normal  0.389982 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3686  rod shape-determining protein MreC  39.43 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000135967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  36.49 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4410  rod shape-determining protein MreC  39.43 
 
 		 334 aa  152  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000283267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0264  rod shape-determining protein MreC  38.62 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.032676  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  37.28 
 
 		 356 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  35.32 
 
 		 367 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  34.94 
 
 		 355 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  34.41 
 
 		 358 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  34.41 
 
 		 358 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  34.41 
 
 		 358 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  34.77 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  34.77 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>