281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03684 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 296 aa  601  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  95.32 
 
 		 299 aa  580  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  77.36 
 
 		 296 aa  457  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  68.5 
 
 		 285 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  53.7 
 
 		 414 aa  308  9e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  54.07 
 
 		 331 aa  286  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  54.07 
 
 		 331 aa  286  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  54.07 
 
 		 331 aa  286  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3834  rod shape-determining protein MreC  54.07 
 
 		 383 aa  285  9e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0283563  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3281  rod shape-determining protein MreC  55.19 
 
 		 361 aa  278  5e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000057378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3733  rod shape-determining protein MreC  55.19 
 
 		 367 aa  278  8e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011451  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03109  cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreC  55.19 
 
 		 367 aa  278  9e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0024282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0457  rod shape-determining protein MreC  55.19 
 
 		 367 aa  278  9e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000354374  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03060  hypothetical protein  55.19 
 
 		 367 aa  278  9e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00317154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3439  rod shape-determining protein MreC  55.19 
 
 		 367 aa  278  9e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3545  rod shape-determining protein MreC  55.19 
 
 		 367 aa  278  9e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000398804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4566  rod shape-determining protein MreC  55.19 
 
 		 367 aa  278  9e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000293229  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0457  rod shape-determining protein MreC  55.19 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00301189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4410  rod shape-determining protein MreC  55.93 
 
 		 334 aa  275  9e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000283267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  49.63 
 
 		 309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3671  rod shape-determining protein MreC  54.44 
 
 		 350 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208863  normal  0.389982 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3733  rod shape-determining protein MreC  54.44 
 
 		 350 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0325244  normal  0.0423358 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3565  rod shape-determining protein MreC  54.44 
 
 		 350 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.145579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3636  rod shape-determining protein MreC  54.44 
 
 		 350 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0150726  hitchhiker  0.00366072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3564  rod shape-determining protein MreC  54.44 
 
 		 350 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00821336  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  48.56 
 
 		 351 aa  272  4.0000000000000004e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0264  rod shape-determining protein MreC  52.5 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.032676  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  45.08 
 
 		 293 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3686  rod shape-determining protein MreC  53.33 
 
 		 338 aa  269  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000135967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  50.74 
 
 		 286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0253  rod shape-determining protein MreC  52.86 
 
 		 327 aa  264  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00109654  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  45.79 
 
 		 291 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  46.35 
 
 		 334 aa  255  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  46.89 
 
 		 294 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  49.08 
 
 		 298 aa  252  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  48.72 
 
 		 298 aa  250  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3737  rod shape-determining protein MreC  47.55 
 
 		 320 aa  249  5e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00218266  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  44.73 
 
 		 326 aa  249  5e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3647  rod shape-determining protein MreC  48.18 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0178406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0498  rod shape-determining protein MreC  47.45 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000920661  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  47.45 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  47.45 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  47.45 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3471  rod shape-determining protein MreC  47.81 
 
 		 353 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0021778  normal  0.815632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0480  rod shape-determining protein MreC  47.81 
 
 		 353 aa  245  8e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.589731  normal  0.326651 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4097  rod shape-determining protein MreC  47.45 
 
 		 355 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  46.21 
 
 		 277 aa  236  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3753  rod shape-determining protein MreC  48.16 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000670381  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  42.49 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  42.31 
 
 		 318 aa  228  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  44.2 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  39.11 
 
 		 317 aa  225  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  43.08 
 
 		 329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  43.08 
 
 		 330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  42.06 
 
 		 332 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  39.78 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  39.78 
 
 		 357 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  42.4 
 
 		 330 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  39.05 
 
 		 362 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  42 
 
 		 325 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  42.86 
 
 		 333 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  40.29 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  40.23 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  38.16 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  39 
 
 		 286 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  43.03 
 
 		 310 aa  195  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  38.66 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  37.65 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  38.49 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  36.63 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  35.9 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  39.11 
 
 		 243 aa  175  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  36.24 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  36.24 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  35.21 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  38.2 
 
 		 369 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  35.58 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  37.45 
 
 		 369 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  36.7 
 
 		 367 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  34.6 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  35.29 
 
 		 356 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  35.29 
 
 		 356 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  34.93 
 
 		 355 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  37.87 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  34.46 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  34.83 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  34.83 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  34.83 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  34.83 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  34.83 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  34.83 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  34.83 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  35.66 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  34.46 
 
 		 358 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  34.46 
 
 		 358 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  34.46 
 
 		 358 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  33.71 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  34.3 
 
 		 359 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  30.07 
 
 		 311 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  35.96 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>