277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0089 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
287 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  42.14 
 
 
286 aa  240  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
317 aa  158  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  36.23 
 
 
277 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  29.66 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  32.49 
 
 
285 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 
286 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  32.6 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  30.86 
 
 
277 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  31.67 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  31.67 
 
 
283 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  35.83 
 
 
273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  30.42 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  30.18 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  31.6 
 
 
276 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  31.37 
 
 
283 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  30.08 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  34.78 
 
 
274 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  32.27 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  30.45 
 
 
292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  28.78 
 
 
281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  31.33 
 
 
291 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  30.18 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  28.88 
 
 
288 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  30.39 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  29.93 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  32.08 
 
 
271 aa  109  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  32.38 
 
 
273 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  30.47 
 
 
283 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  28.25 
 
 
288 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  30.58 
 
 
283 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  30.11 
 
 
283 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  30.11 
 
 
283 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  28.67 
 
 
283 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  29.88 
 
 
291 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  30.68 
 
 
275 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  29.48 
 
 
291 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  29.39 
 
 
283 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  29.48 
 
 
291 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  29.39 
 
 
283 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  28.17 
 
 
283 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  26.47 
 
 
274 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 
357 aa  104  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  28.09 
 
 
317 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  28.79 
 
 
272 aa  102  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  29.55 
 
 
299 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  32.39 
 
 
288 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  28.41 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  25.78 
 
 
288 aa  96.3  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  27.68 
 
 
302 aa  94  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  24.48 
 
 
309 aa  93.2  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  28.47 
 
 
359 aa  90.1  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  27.16 
 
 
348 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  29.17 
 
 
338 aa  89.7  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  28.03 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  25.61 
 
 
348 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1686  rod shape-determining protein MreC  31.2 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  32.16 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  28.69 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  26.46 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  29.88 
 
 
302 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  29.88 
 
 
302 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  26.06 
 
 
286 aa  87.4  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  25.19 
 
 
267 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  25.72 
 
 
283 aa  86.7  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  28.04 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  26.54 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  29.76 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  29.49 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  27.76 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  26.94 
 
 
414 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  26.01 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  26.01 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  30.92 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  27.14 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  28.05 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  25.72 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  27.3 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  29.83 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  28.04 
 
 
279 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  24.05 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  28.84 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  21.99 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  25.64 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  24.65 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  24.81 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1317  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0592341  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  27.08 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  27.08 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0286  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 
249 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 
249 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  25.24 
 
 
254 aa  79  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  26.07 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  29.32 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  22.61 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0106  Rod shape-determining protein MreC  23.9 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>