283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1755 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 274 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  94.16 
 
 		 274 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  64.6 
 
 		 274 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  62.45 
 
 		 274 aa  329  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  64.37 
 
 		 273 aa  301  9e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  55.19 
 
 		 272 aa  300  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  51.09 
 
 		 274 aa  285  7e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  41.64 
 
 		 272 aa  211  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  38.01 
 
 		 281 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  36.92 
 
 		 277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  36 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  36.91 
 
 		 357 aa  149  6e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  30.51 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  32.36 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  30.97 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  38.66 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  36.13 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  34.33 
 
 		 317 aa  143  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  35.77 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  35.06 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  32.58 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  36.23 
 
 		 274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  31.85 
 
 		 275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  29.72 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  31.13 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  37.02 
 
 		 315 aa  123  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  35.9 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  32.91 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  28.29 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  32.2 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  28.96 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  28 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  28.19 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  31.3 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  33.21 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  30.42 
 
 		 271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  34.78 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  32.62 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  27.21 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  33.01 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  28.2 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  27.76 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  36.68 
 
 		 358 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  36.68 
 
 		 358 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  30.68 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  36.68 
 
 		 358 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  36.93 
 
 		 306 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  35.96 
 
 		 355 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  27.82 
 
 		 283 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  34.02 
 
 		 324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  29.96 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  35.15 
 
 		 356 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  27.88 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  35.15 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  34.72 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  34.72 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  34.1 
 
 		 367 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  31.42 
 
 		 296 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  43.31 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  28.85 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  27.21 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  29.81 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  32.99 
 
 		 348 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  32.99 
 
 		 359 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  27.96 
 
 		 288 aa  105  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  30.4 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  30.4 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  32.33 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  34.5 
 
 		 381 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  29.5 
 
 		 336 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  32.99 
 
 		 357 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  32.99 
 
 		 357 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  32.99 
 
 		 357 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  32.99 
 
 		 357 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  36.41 
 
 		 249 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  32.99 
 
 		 357 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  36.41 
 
 		 249 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  28.41 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  32.99 
 
 		 357 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  32.99 
 
 		 357 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  31.4 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  31.96 
 
 		 348 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  31.13 
 
 		 316 aa  102  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  33.91 
 
 		 311 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  31.96 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  33.72 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1413  rod shape-determining protein MreC  36.08 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0196901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  31.78 
 
 		 331 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  31.78 
 
 		 331 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  29.8 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  31.78 
 
 		 331 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  30.18 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  33.53 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  26.88 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  28.69 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  31.22 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  31.55 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  27.92 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  29.89 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>