281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1302 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
283 aa  555  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  36.21 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  30.8 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  29.63 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  32.74 
 
 
286 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  31.72 
 
 
277 aa  125  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  31.18 
 
 
283 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  31.37 
 
 
287 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  31.05 
 
 
283 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  32.06 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  31.74 
 
 
275 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  33.17 
 
 
274 aa  119  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  30.82 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  30.82 
 
 
283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  31.07 
 
 
285 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  29.86 
 
 
283 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  29.6 
 
 
283 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  29.96 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  31.31 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  26.97 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  29.6 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  29.64 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  25.93 
 
 
281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  30.11 
 
 
283 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  32.38 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 
288 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  31.47 
 
 
273 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  26.77 
 
 
274 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  31.31 
 
 
283 aa  105  8e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  27.14 
 
 
274 aa  105  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  26.55 
 
 
292 aa  104  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  30.28 
 
 
273 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 
357 aa  104  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  28.06 
 
 
285 aa  103  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  33.01 
 
 
288 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  31.22 
 
 
282 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  25.75 
 
 
285 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 
278 aa  99.8  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  29.11 
 
 
286 aa  99.8  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  27.68 
 
 
283 aa  98.6  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  27.96 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
276 aa  96.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  23.7 
 
 
283 aa  95.5  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  26.77 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  25.64 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  28.31 
 
 
288 aa  94.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  29.13 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  26.95 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 
300 aa  92  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  26.36 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  28.64 
 
 
296 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  24.89 
 
 
346 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  26.76 
 
 
359 aa  89.7  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  24.88 
 
 
348 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 
249 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 
249 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  27.23 
 
 
286 aa  88.2  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  27.19 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  28.85 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  24.11 
 
 
356 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  25.35 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  26.24 
 
 
292 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  27.37 
 
 
257 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  27.05 
 
 
299 aa  86.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  25.35 
 
 
294 aa  86.3  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  27.54 
 
 
296 aa  86.3  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  28.64 
 
 
272 aa  85.5  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 
287 aa  85.5  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  28.26 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  24.15 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  24.18 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  29.19 
 
 
279 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0866  rod shape-determining protein MreC  26.15 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0106  Rod shape-determining protein MreC  27.47 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1380  rod shape-determining protein MreC  27.44 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  22.75 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  28.43 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  28.9 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  29.56 
 
 
280 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  27.69 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  28.71 
 
 
280 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  28.71 
 
 
280 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  25.14 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  28.7 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  27.94 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  27.45 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  27.45 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1166  rod shape-determining protein MreC  29.36 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  23.39 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  27.94 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7281  Cell shape-determining protein-like protein  28.45 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.205543 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  26.29 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  25.6 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  26.47 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>