243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0106 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0106  Rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 261 aa  511  1e-144  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  23.92 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  24.52 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  27.47 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  25.41 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  23.15 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  25.4 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  23.9 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  28.33 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  24.35 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  27.98 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  22.93 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  21.78 
 
 		 357 aa  75.5  0.0000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 		 326 aa  75.1  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  24.3 
 
 		 267 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  27.01 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  23.71 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  25.75 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  25.27 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  25.11 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  24.15 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  24.15 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  26.56 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  25.27 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  21.96 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  23.79 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  22.8 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  22.17 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  22.01 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  23.85 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  23.93 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  25.77 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  23.43 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  23.76 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  21.03 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  22.31 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  26 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  20.8 
 
 		 334 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  22.36 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  24.55 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  20.65 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  26.19 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  29.56 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1212  rod shape-determining protein MreC  22.18 
 
 		 327 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  25.42 
 
 		 291 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  25.42 
 
 		 291 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  20.97 
 
 		 333 aa  62  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  26.97 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  22.75 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  29.17 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  26.15 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  22.51 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  20.89 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  23.5 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  27.93 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  23.5 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  23.5 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  19.62 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  24.64 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  27.54 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  23.84 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  26.84 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  27.12 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  22.36 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  23.49 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  21.07 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  23.5 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  25.55 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1209  Rod shape-determining protein MreC  22.67 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0276789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  20.92 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  20.66 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  22.98 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18131  rod shape-determining protein MreC  26.98 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570389  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  20.43 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0376  rod shape-determining protein MreC  26.92 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  22.99 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  22.99 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  23.28 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  24.55 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  20.93 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  23.04 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  23.28 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  23.83 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  22.65 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  23.08 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  20.75 
 
 		 362 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  22.52 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  19.64 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  26.83 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  21.9 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  26.05 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  22.41 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  22.99 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  20.68 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  21.4 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  22.73 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  22.73 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  22.41 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  20.97 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  23.01 
 
 		 359 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>