270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0479 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  94.39 
 
 		 286 aa  549  1e-155  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  74.36 
 
 		 306 aa  434  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  35.43 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  35.04 
 
 		 330 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  35.04 
 
 		 362 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  37.09 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  34.73 
 
 		 254 aa  159  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  37.09 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  34.7 
 
 		 328 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  34.13 
 
 		 332 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  34.8 
 
 		 325 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  37.71 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  37.71 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  34.25 
 
 		 357 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  34.65 
 
 		 318 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  34.4 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  34.25 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  34.6 
 
 		 333 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  36.93 
 
 		 407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  35.29 
 
 		 351 aa  145  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  34.44 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  32.48 
 
 		 293 aa  142  9e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  31.09 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  31.64 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  34.19 
 
 		 414 aa  138  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  30.65 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  35.48 
 
 		 448 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  34.39 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 		 267 aa  135  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  35.68 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  31.6 
 
 		 274 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  29.56 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  30.12 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  33.97 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  33.97 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  33.97 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  29.89 
 
 		 309 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  33.09 
 
 		 285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  31.99 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  32.64 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  32.23 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  31.99 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  31.73 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  31.73 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  29.09 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3753  rod shape-determining protein MreC  33.82 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000670381  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  32.01 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  32.57 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  29.02 
 
 		 300 aa  122  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3737  rod shape-determining protein MreC  32.44 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00218266  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  35.29 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  30.63 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  31.05 
 
 		 369 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  30.63 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  31.98 
 
 		 274 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3471  rod shape-determining protein MreC  30.89 
 
 		 353 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0021778  normal  0.815632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0480  rod shape-determining protein MreC  30.89 
 
 		 353 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.589731  normal  0.326651 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  27.41 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0264  rod shape-determining protein MreC  36.14 
 
 		 327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.032676  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4097  rod shape-determining protein MreC  30.89 
 
 		 355 aa  119  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3647  rod shape-determining protein MreC  30.89 
 
 		 353 aa  119  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0178406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  30.97 
 
 		 310 aa  118  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3834  rod shape-determining protein MreC  33.46 
 
 		 383 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0283563  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  31.54 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  31.68 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  31.68 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  30.66 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  31.68 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0498  rod shape-determining protein MreC  31.68 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000920661  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  30.36 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  30.57 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4410  rod shape-determining protein MreC  35.02 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000283267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  28.15 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  27.48 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  27.04 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0457  rod shape-determining protein MreC  36.14 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00301189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  28.47 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  30.3 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03109  cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreC  36.14 
 
 		 367 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0024282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0457  rod shape-determining protein MreC  36.14 
 
 		 367 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000354374  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4566  rod shape-determining protein MreC  36.14 
 
 		 367 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000293229  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03060  hypothetical protein  36.14 
 
 		 367 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00317154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3281  rod shape-determining protein MreC  36.14 
 
 		 361 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000057378  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3545  rod shape-determining protein MreC  36.14 
 
 		 367 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000398804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3439  rod shape-determining protein MreC  36.14 
 
 		 367 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626675  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3733  rod shape-determining protein MreC  36.14 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011451  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  27.94 
 
 		 357 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  27.94 
 
 		 357 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  27.94 
 
 		 357 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  27.94 
 
 		 357 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  27.94 
 
 		 357 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  27.94 
 
 		 357 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  27.94 
 
 		 357 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3686  rod shape-determining protein MreC  35.74 
 
 		 338 aa  108  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000135967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3636  rod shape-determining protein MreC  35.92 
 
 		 350 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0150726  hitchhiker  0.00366072 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  34 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0253  rod shape-determining protein MreC  35.85 
 
 		 327 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00109654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>