260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_18131 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_18131  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 249 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570389  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  84.34 
 
 		 249 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  83.53 
 
 		 250 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  67.07 
 
 		 249 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  46.28 
 
 		 247 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  46.23 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  41.94 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01801  rod shape-determining protein MreC  43.04 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  41.13 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0150  rod shape-determining protein MreC  41.86 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  38.79 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  34.1 
 
 		 249 aa  144  9e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  34.73 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  30.64 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  30.64 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  32.41 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  28.97 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  28.4 
 
 		 265 aa  104  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  30.66 
 
 		 274 aa  92.8  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  31.65 
 
 		 273 aa  88.6  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  35.84 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  31.94 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  29.88 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  31.47 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  35.66 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  29.29 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  29.28 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  30.11 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  31.4 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  28.24 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  26.82 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  27.59 
 
 		 281 aa  75.1  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  25.97 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  25.29 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1209  Rod shape-determining protein MreC  27.93 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0276789  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  27.62 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  33.92 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  27.62 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  30.59 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  27.42 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  31.17 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  27.22 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  27.22 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  31.17 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  29.34 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  27.92 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  30.56 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  28.92 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  29.65 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  26.21 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  29.28 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  31.17 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  26.97 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  29.53 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  27.38 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  26.55 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  27.38 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  26.56 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  25.16 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  30.52 
 
 		 332 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  30.52 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  30.52 
 
 		 330 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  30.34 
 
 		 328 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  29.87 
 
 		 362 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  29.34 
 
 		 282 aa  68.6  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  30.19 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  30.19 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1570  rod shape-determining protein MreC  30.17 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  27.22 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  26.06 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  30.23 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  28.73 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  26.19 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  25.11 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  25.11 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  25.11 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  31.17 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  29.87 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  28.77 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  25.15 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  27.11 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  30.06 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  29.75 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  27.74 
 
 		 316 aa  65.5  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  25.14 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  27.91 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  27.74 
 
 		 316 aa  65.5  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  26.25 
 
 		 311 aa  65.1  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  28.34 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  27.59 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  24.74 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  26.88 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0839  Rod shape-determining protein MreC  31.85 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>