280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06080 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
315 aa  621  1e-177  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  51.62 
 
 
292 aa  281  9e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  44.03 
 
 
302 aa  228  9e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  42.8 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  31.14 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  34.06 
 
 
274 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  31.62 
 
 
304 aa  122  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  33.99 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  30.43 
 
 
272 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  33.5 
 
 
283 aa  116  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  31.95 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  31.8 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  33.5 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  35.44 
 
 
274 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  37.5 
 
 
273 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  34.11 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  32.69 
 
 
359 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  35.74 
 
 
274 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  29.05 
 
 
271 aa  107  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 
285 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  27.82 
 
 
277 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  29.43 
 
 
292 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  33.16 
 
 
273 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  34.58 
 
 
288 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  31.35 
 
 
277 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  36.6 
 
 
272 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  33.85 
 
 
275 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  31.09 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  32.34 
 
 
286 aa  97.1  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 
285 aa  97.1  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  29.78 
 
 
281 aa  97.1  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  28.92 
 
 
283 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  27.76 
 
 
283 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  31.61 
 
 
280 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  31.61 
 
 
280 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  27.4 
 
 
283 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  26.97 
 
 
251 aa  92.4  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  26.69 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  27.05 
 
 
283 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  26.69 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  28.04 
 
 
283 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1528  rod shape-determining protein MreC  28.62 
 
 
306 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.187391  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  33.47 
 
 
274 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  26.35 
 
 
311 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  26.76 
 
 
283 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  28.46 
 
 
331 aa  90.1  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  28.46 
 
 
331 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  28.46 
 
 
331 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  28.68 
 
 
292 aa  89.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  27.66 
 
 
283 aa  89.4  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  27.18 
 
 
283 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  28.38 
 
 
414 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  26.74 
 
 
288 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  24.7 
 
 
288 aa  86.7  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  25.36 
 
 
283 aa  86.7  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  27.85 
 
 
336 aa  85.9  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  27.24 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  32.37 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  36 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  30.3 
 
 
283 aa  84  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  28.62 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  31.78 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  34.89 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  34.36 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  34.36 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  32.74 
 
 
249 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  27.94 
 
 
367 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  28.77 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  26.69 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  28.26 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  28.67 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  26.47 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1380  rod shape-determining protein MreC  27.51 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  26.9 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  26.25 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  29.61 
 
 
296 aa  79  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  26.89 
 
 
286 aa  79  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5926  Rod shape-determining protein MreC  29.03 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  27.24 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  27.24 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  27.24 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  28.08 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  32.37 
 
 
311 aa  77  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  28.31 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  25.83 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  27.31 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  27.13 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  25.25 
 
 
367 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  25.28 
 
 
294 aa  77  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  31.46 
 
 
296 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>