172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2467 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 366 aa  686    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7281  Cell shape-determining protein-like protein  57.48 
 
 		 317 aa  298  9e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.205543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1540  rod shape-determining protein MreC  53.95 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.211291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  43.88 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0749  rod shape-determining protein MreC  42.19 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7284  rod shape-determining protein MreC  40.34 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5268  rod shape-determining protein MreC  40.68 
 
 		 336 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1212  rod shape-determining protein MreC  40.07 
 
 		 327 aa  155  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3464  rod shape-determining protein MreC  37.45 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.187709  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1686  rod shape-determining protein MreC  51.57 
 
 		 273 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0852  rod shape-determining protein MreC  35.66 
 
 		 248 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0888455 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09210  cell shape-determining protein  34.59 
 
 		 425 aa  93.2  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.76787 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  26.77 
 
 		 357 aa  87.4  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 		 292 aa  86.3  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  26.41 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 		 286 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  27.46 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  26.48 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  23.47 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  32.67 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  27.66 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  29.3 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  28.24 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  25.99 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  21.6 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  21.6 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  29.95 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  27 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  27.46 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  25.2 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  30.56 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  27.72 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  30.43 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  26.96 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  24.42 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  26.86 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  26.86 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  29.27 
 
 		 283 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  27.87 
 
 		 274 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  26.43 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  28.86 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  26.92 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1457  rod shape-determining protein MreC  24.69 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  24.14 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  24.14 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  29.65 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  25.71 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  25.62 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  26.57 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0807  rod shape-determining protein MreC  26.15 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  27.72 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  25.19 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  25.56 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  32.28 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  29.13 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  25.8 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1282  rod shape-determining protein MreC  28.98 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  28.76 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  25.63 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3307  rod shape-determining protein MreC  26.64 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.198941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  26.98 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  23.27 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0866  rod shape-determining protein MreC  29.19 
 
 		 280 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  33.09 
 
 		 266 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  26.99 
 
 		 280 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  24.78 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  26.05 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  26.34 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  26.64 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  26.43 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4600  rod shape-determining protein MreC  28.86 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  27.81 
 
 		 330 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  29.75 
 
 		 291 aa  57  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  28.72 
 
 		 281 aa  57  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  28.85 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  26.27 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  28.32 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  27.81 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  25.35 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  29.11 
 
 		 249 aa  55.8  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  26.41 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  25.35 
 
 		 299 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  29.58 
 
 		 274 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  24.6 
 
 		 279 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5926  Rod shape-determining protein MreC  28.29 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  33.79 
 
 		 273 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  28.05 
 
 		 304 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  28.06 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 		 288 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  25.65 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  25.65 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  26.5 
 
 		 254 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  24.8 
 
 		 251 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  25.51 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>