175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3464 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3464  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 302 aa  589  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.187709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7281  Cell shape-determining protein-like protein  38.01 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.205543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1540  rod shape-determining protein MreC  40.23 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.211291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  37.64 
 
 		 366 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0749  rod shape-determining protein MreC  40.73 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  37.76 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7284  rod shape-determining protein MreC  34.85 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1212  rod shape-determining protein MreC  35.71 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5268  rod shape-determining protein MreC  35.21 
 
 		 336 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1686  rod shape-determining protein MreC  38.46 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0852  rod shape-determining protein MreC  34.87 
 
 		 248 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0888455 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 		 357 aa  92.4  9e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  30.93 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  31.91 
 
 		 292 aa  86.3  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09210  cell shape-determining protein  32.93 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.76787 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  25.34 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  30.19 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  28.37 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  28.7 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  31.88 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  29.21 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  31.82 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  24.63 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  24.63 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  31.5 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  30.1 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  25.55 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  29.5 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1528  rod shape-determining protein MreC  28.2 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.187391  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  28.47 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  25.12 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  26.24 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  26.48 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  29.6 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  28.98 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  25.27 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  30.74 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  31.07 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  27.24 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  25.63 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  28.08 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  30.13 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  30.43 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2129  rod shape-determining protein MreC  31.02 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  22.05 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  28.93 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  31.19 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  29.65 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  25.15 
 
 		 287 aa  57  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  22.65 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  28 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  27.82 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  24.9 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  28.3 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  29.25 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  22.22 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  32.07 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5926  Rod shape-determining protein MreC  24.53 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  26.24 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  25.82 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1671  rod shape-determining protein MreC  30.36 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575744 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  24.63 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  28.77 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  26.17 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  29.1 
 
 		 329 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  29.05 
 
 		 274 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  27.53 
 
 		 311 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0582  rod shape-determining protein MreC  30.66 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254357  hitchhiker  0.0000000000148886 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  23.32 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  28.1 
 
 		 330 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  25.89 
 
 		 288 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 		 249 aa  52.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1317  rod shape-determining protein MreC  24.08 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0592341  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  31.11 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  24.12 
 
 		 278 aa  52.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  28.5 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  31.11 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  31.98 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  31.11 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  30.05 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  22.67 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  29.29 
 
 		 274 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  27.91 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 		 367 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  25.46 
 
 		 336 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1209  Rod shape-determining protein MreC  28.88 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0276789  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  29.37 
 
 		 316 aa  50.4  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0767  rod shape-determining protein MreC  34.62 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0236544  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  26.21 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  26.07 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  29.56 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  31.53 
 
 		 381 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  27.42 
 
 		 357 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  27.42 
 
 		 357 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 		 407 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>