210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7281 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7281  Cell shape-determining protein-like protein  100 
 
 
317 aa  611  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.205543 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  57.53 
 
 
366 aa  311  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1540  rod shape-determining protein MreC  48.47 
 
 
327 aa  267  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.211291  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0749  rod shape-determining protein MreC  40.18 
 
 
323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302394  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  40.34 
 
 
298 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7284  rod shape-determining protein MreC  40.97 
 
 
290 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1212  rod shape-determining protein MreC  38 
 
 
327 aa  163  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3464  rod shape-determining protein MreC  38.41 
 
 
302 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.187709  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5268  rod shape-determining protein MreC  37.46 
 
 
336 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1686  rod shape-determining protein MreC  47.53 
 
 
273 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0852  rod shape-determining protein MreC  34.94 
 
 
248 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0888455 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  32.12 
 
 
292 aa  86.3  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  25.98 
 
 
357 aa  84  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09210  cell shape-determining protein  31.56 
 
 
425 aa  83.2  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.76787 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  28.45 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  33.98 
 
 
274 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  26.76 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  33.73 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  27.82 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  33.73 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  27.34 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  28.17 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  29.48 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  29.48 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  30.58 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  30.18 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  28.17 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  26.24 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  26.24 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  29.09 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  25.65 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  26.26 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  29.76 
 
 
288 aa  72  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  27.11 
 
 
283 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  29.38 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  28.72 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  29.95 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  30.52 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  27.11 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  26.62 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  27.68 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  26.24 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  29.11 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  26.41 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  29.5 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  32.64 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  31.05 
 
 
281 aa  67  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  28.89 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  27.78 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  30.46 
 
 
286 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  25.53 
 
 
283 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  25.86 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  23.64 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  29.31 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1282  rod shape-determining protein MreC  28.99 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  30.7 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  30.1 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  29.56 
 
 
274 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  30.62 
 
 
243 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  28.85 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  34.93 
 
 
283 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  28.04 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  27.97 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  32.43 
 
 
249 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1528  rod shape-determining protein MreC  35.48 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.187391  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 
292 aa  63.9  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  30.36 
 
 
291 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  31.61 
 
 
292 aa  63.5  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  28.5 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  27.09 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  30.52 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  27.54 
 
 
257 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 
287 aa  60.8  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  30.05 
 
 
291 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  23.81 
 
 
280 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  23.81 
 
 
280 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  30.05 
 
 
291 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 
300 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  27.78 
 
 
254 aa  60.1  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  27.96 
 
 
291 aa  60.5  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  28.5 
 
 
285 aa  60.1  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  30.1 
 
 
329 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  30.1 
 
 
330 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 
300 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  30.21 
 
 
266 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  31.79 
 
 
285 aa  59.7  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  29.31 
 
 
291 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  26.8 
 
 
285 aa  58.9  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 
304 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  27.54 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  27.11 
 
 
338 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  23.77 
 
 
257 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  28.27 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 
272 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0711  rod shape-determining protein MreC  27.08 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  24.5 
 
 
315 aa  57.8  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>