231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1164 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 263 aa  503  1e-141  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2603  Rod shape-determining protein MreC  67.36 
 
 		 263 aa  296  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  35.55 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  31.16 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 		 274 aa  92.8  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  34.65 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  30.71 
 
 		 302 aa  89.4  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  35.35 
 
 		 448 aa  87.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  26.62 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  33.05 
 
 		 407 aa  87.8  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  32.16 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  30.84 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  31.14 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  30.92 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  33.5 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  31.88 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  33.66 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  31.38 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  32.34 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  27.16 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  31.38 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  30.15 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  32.61 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  32.89 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  29.92 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  28.62 
 
 		 292 aa  78.6  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  25.19 
 
 		 285 aa  78.6  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  31.84 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  31.84 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  26.11 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1403  Rod shape-determining protein MreC  26.13 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000400857  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  31.55 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  28.86 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  27.86 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  25.89 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  27.17 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  31.53 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  27.03 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  22.9 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  30.24 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  29.95 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0150  rod shape-determining protein MreC  34.07 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  22.52 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  30.35 
 
 		 324 aa  72  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1457  rod shape-determining protein MreC  24.88 
 
 		 276 aa  72  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  32.76 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  30.94 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  32.18 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  31.61 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  31.61 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  29.26 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  32.76 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  32.18 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  32.39 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  33.15 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  33.15 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  35 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  31.61 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  33.8 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  30.92 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 		 348 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  29.28 
 
 		 358 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  29.28 
 
 		 358 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  26.34 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  29.28 
 
 		 358 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  30.05 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  24.73 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  30.43 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  31.64 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  30.98 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  30.43 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  32.29 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  31.22 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  28.25 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  21.53 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3307  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.198941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  24.36 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  24.36 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  30.98 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  31.75 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  25.27 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7281  Cell shape-determining protein-like protein  30.1 
 
 		 317 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.205543 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  31.61 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  24.36 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  28.5 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  22.81 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01801  rod shape-determining protein MreC  32.93 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>