204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_01801 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_01801  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
247 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  69.33 
 
 
248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0150  rod shape-determining protein MreC  68.2 
 
 
248 aa  297  1e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  57.79 
 
 
247 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  55.75 
 
 
251 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  54.87 
 
 
251 aa  251  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  43.16 
 
 
249 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  44.3 
 
 
249 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  43.04 
 
 
250 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18131  rod shape-determining protein MreC  43.04 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570389  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  43.24 
 
 
249 aa  179  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  40.19 
 
 
251 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  38.96 
 
 
257 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  39.75 
 
 
256 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 
249 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 
249 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  37.14 
 
 
273 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  35.15 
 
 
265 aa  125  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  32.68 
 
 
285 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  35.19 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  29.11 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1209  Rod shape-determining protein MreC  31.87 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0276789  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  34.62 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  29.22 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  30.59 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  30.73 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  29.1 
 
 
288 aa  72  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  26.11 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  29.65 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  33.12 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  32.35 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  30.48 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  34.04 
 
 
274 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  29.63 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  28.66 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  30.85 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  27.49 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  30.71 
 
 
274 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  31.48 
 
 
381 aa  67  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  29.32 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  28.65 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  30.94 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  27.88 
 
 
357 aa  65.9  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  28.43 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  28.43 
 
 
329 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  31.21 
 
 
311 aa  65.5  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  27.6 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  34.39 
 
 
263 aa  65.1  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  28.21 
 
 
274 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  27.68 
 
 
285 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  28.72 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  28.19 
 
 
283 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  26.6 
 
 
283 aa  64.7  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  30.18 
 
 
288 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 
356 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  26.94 
 
 
285 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  29.79 
 
 
283 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  28.41 
 
 
280 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 
285 aa  62.8  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  28.41 
 
 
280 aa  63.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4600  rod shape-determining protein MreC  28.26 
 
 
253 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  29.58 
 
 
274 aa  62.8  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  29.26 
 
 
299 aa  62.8  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  31.91 
 
 
315 aa  62.4  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  29.79 
 
 
317 aa  62.4  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 
286 aa  62  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  29.03 
 
 
296 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0839  Rod shape-determining protein MreC  27.61 
 
 
284 aa  61.2  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  27.68 
 
 
285 aa  61.6  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  36.7 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  26.3 
 
 
304 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  29.03 
 
 
299 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  26.21 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  28.65 
 
 
279 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  27.66 
 
 
283 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  27.66 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  27.66 
 
 
283 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  27.67 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  29.14 
 
 
317 aa  60.1  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  26.51 
 
 
271 aa  60.1  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  30.61 
 
 
334 aa  60.1  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  28.77 
 
 
326 aa  60.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  28.74 
 
 
318 aa  60.1  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  27.93 
 
 
315 aa  59.7  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  27.56 
 
 
281 aa  59.7  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  27.66 
 
 
283 aa  59.7  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  30.29 
 
 
367 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  27.78 
 
 
275 aa  59.7  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  28.9 
 
 
306 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  28.9 
 
 
305 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  28.9 
 
 
305 aa  58.5  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1628  rod shape-determining protein MreC  29.48 
 
 
300 aa  58.5  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  30.43 
 
 
369 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  26.6 
 
 
283 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  25.93 
 
 
307 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  29.71 
 
 
369 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  28.31 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>