272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1151 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
251 aa  510  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  48.16 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  48.16 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  50.66 
 
 
257 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  47.74 
 
 
249 aa  227  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  48.44 
 
 
256 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  43.38 
 
 
273 aa  203  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  41.5 
 
 
265 aa  202  6e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0150  rod shape-determining protein MreC  40 
 
 
248 aa  162  6e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  40.09 
 
 
248 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01801  rod shape-determining protein MreC  40.19 
 
 
247 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  35.34 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  35.98 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  36.62 
 
 
250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
251 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18131  rod shape-determining protein MreC  38.79 
 
 
249 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570389  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  32.93 
 
 
251 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  33.64 
 
 
249 aa  142  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  34.12 
 
 
273 aa  105  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  34.72 
 
 
285 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  37.76 
 
 
274 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  33.52 
 
 
274 aa  99.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  37.23 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  31.67 
 
 
304 aa  92.8  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  31.95 
 
 
292 aa  93.2  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  35.71 
 
 
272 aa  92.4  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  31.95 
 
 
315 aa  92  8e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  38.55 
 
 
275 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  31.86 
 
 
277 aa  89  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 
282 aa  89  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  36.48 
 
 
274 aa  88.6  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  28.95 
 
 
362 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  36.3 
 
 
273 aa  86.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  33.73 
 
 
286 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  27.88 
 
 
277 aa  85.9  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  32.02 
 
 
310 aa  85.9  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  32.9 
 
 
316 aa  85.5  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  32.9 
 
 
316 aa  85.5  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  32.4 
 
 
276 aa  85.1  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  32.96 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  30.49 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  29.38 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  30.46 
 
 
267 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  29.38 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  28.03 
 
 
302 aa  84  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  29.38 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  29.88 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  30.86 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  32.75 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  34.15 
 
 
407 aa  82.8  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  30.86 
 
 
359 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  34.06 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  31.63 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  32.16 
 
 
300 aa  82  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  32.16 
 
 
300 aa  82  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  32.95 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  29.61 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  34.12 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  34.03 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  30.86 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  26.27 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  28.11 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  30.25 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  26.27 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  30.25 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  30.25 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  29.33 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  29.8 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  30.97 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  29.8 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  28.48 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  33.56 
 
 
448 aa  79  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  31.41 
 
 
279 aa  79  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  29.25 
 
 
359 aa  78.6  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  29.73 
 
 
296 aa  79  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  27.43 
 
 
306 aa  78.6  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 
315 aa  78.6  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  31.06 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  30.19 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  28.29 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  31.21 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  27.45 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  31.33 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0286  rod shape-determining protein MreC  32.48 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  29.11 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  29.94 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  31.21 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  29.08 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 
311 aa  75.5  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  28.41 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  28.77 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  30.94 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0106  Rod shape-determining protein MreC  25.75 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>