262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1460 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
273 aa  551  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  70.15 
 
 
265 aa  384  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  44.84 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  44.84 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  45.57 
 
 
257 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  43.38 
 
 
251 aa  203  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  43.19 
 
 
256 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  38.67 
 
 
249 aa  181  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0150  rod shape-determining protein MreC  37.78 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  36.82 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01801  rod shape-determining protein MreC  37.67 
 
 
247 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  33.06 
 
 
247 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  33.46 
 
 
251 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  33.46 
 
 
251 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 
249 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  30.08 
 
 
249 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  28.69 
 
 
250 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18131  rod shape-determining protein MreC  28.97 
 
 
249 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570389  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  33.73 
 
 
272 aa  97.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  35.47 
 
 
273 aa  95.5  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  34.55 
 
 
274 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  33.66 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
274 aa  90.1  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 
286 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  31.55 
 
 
306 aa  87  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  32.16 
 
 
286 aa  87  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  35.92 
 
 
274 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  36.96 
 
 
274 aa  86.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  31.96 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  29.69 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  30.61 
 
 
359 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  30.54 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  37.32 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  30.96 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  32.29 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  31.77 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  31.02 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  31.77 
 
 
300 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  31.61 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  32.37 
 
 
283 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  28.95 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  28.1 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  31.18 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  31.67 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  31.98 
 
 
329 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  31.98 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  31.76 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  30.99 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  31.87 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  32.02 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  30.61 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  31.72 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  31.96 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  30.06 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1209  Rod shape-determining protein MreC  29.83 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0276789  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  31.72 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  26.34 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  29.95 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  31.11 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  29.65 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  32.45 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  31.18 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  30.23 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  29.65 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0106  Rod shape-determining protein MreC  27.01 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  31.73 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  31.32 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  28.5 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  31.32 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  30.41 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  32.87 
 
 
334 aa  72.8  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  31.44 
 
 
381 aa  72.8  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  32.12 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  29.57 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  28.8 
 
 
367 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  28.12 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  30.41 
 
 
291 aa  72  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  29.39 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  32.74 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  30.41 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  28.11 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  30.52 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  31.21 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  31.21 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  29.87 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  31.76 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  28.8 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  29.7 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  28.18 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  29.89 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  29.87 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  30.95 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  29.89 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  29.89 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  29.07 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>