274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4129 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
249 aa  498  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
249 aa  498  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  60.8 
 
 
257 aa  315  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  48.16 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  45.9 
 
 
249 aa  227  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  49.79 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  44.84 
 
 
273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  43.55 
 
 
265 aa  211  5.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0150  rod shape-determining protein MreC  37.61 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  40 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01801  rod shape-determining protein MreC  36.41 
 
 
247 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  33.89 
 
 
247 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  30.89 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  35.14 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  35.14 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  33.64 
 
 
249 aa  128  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  32.08 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18131  rod shape-determining protein MreC  30.51 
 
 
249 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570389  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  37.59 
 
 
272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  38.79 
 
 
273 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  32.86 
 
 
285 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  36.25 
 
 
274 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 
274 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  33.56 
 
 
317 aa  97.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  36.97 
 
 
357 aa  97.1  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  33.75 
 
 
274 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  36.26 
 
 
274 aa  97.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  32.32 
 
 
277 aa  96.3  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  32.46 
 
 
286 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  31.96 
 
 
316 aa  95.1  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  36.41 
 
 
274 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  33.79 
 
 
359 aa  94.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  31.96 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  35.75 
 
 
275 aa  94  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  35.67 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  29.11 
 
 
306 aa  89.7  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 
304 aa  89.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  32.26 
 
 
309 aa  89.4  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 
283 aa  89  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  29.09 
 
 
281 aa  88.6  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  26.55 
 
 
286 aa  87  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  26.09 
 
 
286 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  32.57 
 
 
302 aa  86.3  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  32.57 
 
 
302 aa  86.3  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  34.21 
 
 
317 aa  85.9  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  31.06 
 
 
285 aa  85.5  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  30.17 
 
 
329 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  33.53 
 
 
294 aa  84  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  30.17 
 
 
330 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  29.49 
 
 
277 aa  84  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  30.69 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  31.38 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  32.04 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  34.36 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  29.82 
 
 
324 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  32.52 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  27.2 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  33.73 
 
 
448 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  32.03 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  31.55 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  35.9 
 
 
407 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  32.39 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  30.99 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  30.99 
 
 
357 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  33.56 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  31.98 
 
 
283 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  27.48 
 
 
318 aa  79.3  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  28.64 
 
 
310 aa  79  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 
287 aa  79  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  25.85 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  29.21 
 
 
325 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  32.39 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  30.95 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  29.56 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  29.82 
 
 
332 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  30.36 
 
 
300 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  29.82 
 
 
330 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  30.36 
 
 
300 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  28.65 
 
 
333 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  32.14 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  30.18 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7281  Cell shape-determining protein-like protein  33.73 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.205543 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  30.06 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0286  rod shape-determining protein MreC  30.82 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  28.92 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  29.32 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  31.09 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  32.26 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  31.09 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  30.59 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  31.35 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  31.33 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1209  Rod shape-determining protein MreC  26.48 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0276789  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  27.56 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  31.72 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  31.05 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 
288 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>