274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1258 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
292 aa  569  1e-161  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  51.62 
 
 
315 aa  251  1e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  45.56 
 
 
302 aa  218  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  38.78 
 
 
357 aa  171  9e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  30.45 
 
 
287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  31.05 
 
 
317 aa  119  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  33.7 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  33.46 
 
 
274 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  28.62 
 
 
286 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  37.62 
 
 
274 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  34.11 
 
 
304 aa  115  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  31.68 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  38.22 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  30.99 
 
 
292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  33.47 
 
 
273 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  30.18 
 
 
281 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  29.43 
 
 
275 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  35.9 
 
 
274 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  33.46 
 
 
295 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  26.55 
 
 
283 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1528  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 
306 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.187391  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 
277 aa  99.4  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  29.04 
 
 
356 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  31.27 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  25.65 
 
 
283 aa  96.7  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  32.31 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1540  rod shape-determining protein MreC  33.2 
 
 
327 aa  95.5  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.211291  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 
336 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  25.28 
 
 
283 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  34.3 
 
 
249 aa  94.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  31.2 
 
 
274 aa  94.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  29.3 
 
 
306 aa  94.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7284  rod shape-determining protein MreC  30.86 
 
 
290 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  31.95 
 
 
251 aa  93.2  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  29.03 
 
 
311 aa  92.4  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  30.43 
 
 
281 aa  92.4  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  26.12 
 
 
311 aa  91.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  31.56 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  35.81 
 
 
291 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  26.13 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  34.45 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 
257 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  34.03 
 
 
291 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  32.86 
 
 
296 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  35.53 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  39.25 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  26.54 
 
 
306 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  32.27 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 
366 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  27.47 
 
 
311 aa  87.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1212  rod shape-determining protein MreC  34.56 
 
 
327 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  29.51 
 
 
369 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  31.34 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  31.68 
 
 
359 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  36.29 
 
 
274 aa  87  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  28.73 
 
 
367 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  28.89 
 
 
414 aa  86.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  30.08 
 
 
296 aa  86.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  33.01 
 
 
288 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 
324 aa  85.9  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  31.22 
 
 
274 aa  85.9  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  25.93 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  28.47 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  27.12 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  32.82 
 
 
346 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  33.15 
 
 
348 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  26.39 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  28.35 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  29.18 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7281  Cell shape-determining protein-like protein  31.8 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.205543 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  32.58 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  33.15 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  28.73 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  27.16 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  31.38 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  31.38 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  31.63 
 
 
355 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  31.18 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  33.84 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  27.17 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  36 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  27.5 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  26.51 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  26.51 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  30.6 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  27.76 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  35.46 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5268  rod shape-determining protein MreC  34.42 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  29.23 
 
 
300 aa  79  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  26.79 
 
 
305 aa  79.3  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  33.95 
 
 
251 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  29.5 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  29.19 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  27.53 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  29.5 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0852  rod shape-determining protein MreC  37.04 
 
 
248 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0888455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>