222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1540 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1540  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
327 aa  630  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.211291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  54.24 
 
 
366 aa  287  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7281  Cell shape-determining protein-like protein  52.03 
 
 
317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.205543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  48.99 
 
 
298 aa  230  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0749  rod shape-determining protein MreC  44.11 
 
 
323 aa  208  8e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302394  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7284  rod shape-determining protein MreC  43.64 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1212  rod shape-determining protein MreC  41.67 
 
 
327 aa  186  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5268  rod shape-determining protein MreC  41.59 
 
 
336 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3464  rod shape-determining protein MreC  41.6 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.187709  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0852  rod shape-determining protein MreC  42.49 
 
 
248 aa  162  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0888455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1686  rod shape-determining protein MreC  52.2 
 
 
273 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  33.98 
 
 
292 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09210  cell shape-determining protein  33.46 
 
 
425 aa  97.1  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.76787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  27.67 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  36.62 
 
 
274 aa  90.1  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  32.08 
 
 
304 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  27.97 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  28.37 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  28.72 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  27.74 
 
 
283 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  28.78 
 
 
359 aa  83.2  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  28.03 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  27.4 
 
 
283 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  28.03 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  33.89 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  33.5 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  27.68 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  27.68 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  27.68 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  32.99 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  26.44 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1282  rod shape-determining protein MreC  33.1 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1671  rod shape-determining protein MreC  35.93 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575744 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  24.03 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 
288 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  27.57 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  28.22 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  29.69 
 
 
277 aa  77  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  26.55 
 
 
302 aa  77  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  32.84 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  28.03 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  29.97 
 
 
285 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  26.28 
 
 
286 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  29.01 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  29.63 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  29.62 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  24.64 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  25.91 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  25.91 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 
272 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 
319 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  29.5 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  28.38 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  32.89 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  28.38 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  27.39 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  26.94 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  33.15 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  26.64 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  27.75 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  27.35 
 
 
300 aa  67  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  29.39 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  30.56 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  28.06 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  26.03 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  27.95 
 
 
324 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  25.45 
 
 
285 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0767  rod shape-determining protein MreC  33.2 
 
 
280 aa  64.7  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0236544  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  29.84 
 
 
369 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  28.27 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  28 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2129  rod shape-determining protein MreC  36.42 
 
 
301 aa  63.9  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  30.89 
 
 
249 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  30.89 
 
 
249 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  29.74 
 
 
311 aa  63.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  31.13 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  28.07 
 
 
266 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  29.46 
 
 
369 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  25.79 
 
 
338 aa  63.2  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  29.18 
 
 
331 aa  62.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  29.18 
 
 
331 aa  62.8  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  29.18 
 
 
331 aa  62.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  32.79 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  29.48 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  24.8 
 
 
283 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  29.29 
 
 
326 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  27.88 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  29.74 
 
 
274 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  25.73 
 
 
302 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  25.73 
 
 
302 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  27.95 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  25.48 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  25.91 
 
 
282 aa  60.8  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  24.56 
 
 
281 aa  60.5  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  28.4 
 
 
414 aa  60.1  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  29.03 
 
 
310 aa  59.7  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
311 aa  59.3  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.178168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>