271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2821 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 319 aa  623  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  55.04 
 
 		 304 aa  294  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  56.2 
 
 		 285 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  51.32 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  47.88 
 
 		 283 aa  205  7e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  43.75 
 
 		 338 aa  199  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  36.32 
 
 		 274 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  35.24 
 
 		 274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  36.92 
 
 		 272 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  31.06 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  37.38 
 
 		 273 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  34.68 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  35.55 
 
 		 274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  35 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  38.72 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  34.1 
 
 		 277 aa  113  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  33.96 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  32.1 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  31.82 
 
 		 369 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  36.46 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  34.86 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  31.16 
 
 		 359 aa  105  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  34.96 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  32.51 
 
 		 357 aa  105  9e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  34.55 
 
 		 291 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  32.1 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  34.09 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  31.46 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  37.5 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  36.87 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  35.27 
 
 		 286 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  34.62 
 
 		 351 aa  99.8  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  36.02 
 
 		 317 aa  99.4  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  28.22 
 
 		 296 aa  99.4  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  35.38 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  30.5 
 
 		 286 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  32.14 
 
 		 414 aa  97.1  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  32.13 
 
 		 291 aa  96.7  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  28.81 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  36.32 
 
 		 304 aa  95.9  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  36.02 
 
 		 274 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  32.33 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  30.93 
 
 		 356 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  30.84 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  27.69 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  32 
 
 		 288 aa  92.4  9e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  34.89 
 
 		 300 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  30.28 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  36.48 
 
 		 292 aa  92.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  33.04 
 
 		 334 aa  91.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  29.59 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  33.5 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  30.34 
 
 		 326 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 		 357 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 		 357 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 		 357 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 		 357 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  31.6 
 
 		 254 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 		 357 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 		 357 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 		 357 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  28.04 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  29.63 
 
 		 355 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  31.37 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 		 359 aa  90.1  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 		 331 aa  89.7  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 		 331 aa  89.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 		 331 aa  89.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  32.61 
 
 		 277 aa  89.7  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  27.6 
 
 		 287 aa  89  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  28.98 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  28.98 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  30.46 
 
 		 288 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  28.81 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  28.98 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  28.81 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 		 348 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  30.08 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 		 288 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  29.84 
 
 		 367 aa  86.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  30.71 
 
 		 330 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  31.94 
 
 		 292 aa  85.9  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  27.83 
 
 		 336 aa  86.3  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  28.93 
 
 		 348 aa  85.9  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  28.91 
 
 		 306 aa  85.9  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  30.71 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  31.44 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  31.44 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  30.45 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  34.17 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  32.97 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  29.17 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3737  rod shape-determining protein MreC  34.47 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00218266  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  29.72 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  30.52 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  35.32 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  25.62 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  28.32 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  33.53 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>