267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1249 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 333 aa  668    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  36.78 
 
 		 292 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  30.72 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  37.59 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  34.63 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  31.78 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  29.75 
 
 		 291 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  30.58 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  32.06 
 
 		 300 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  32.24 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  33.21 
 
 		 357 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  32.55 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  32.66 
 
 		 254 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  30.27 
 
 		 267 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  33.46 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  32.37 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  31.74 
 
 		 243 aa  122  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  31.35 
 
 		 286 aa  122  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  32.95 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  30.94 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  31.15 
 
 		 330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  30.88 
 
 		 329 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  35.58 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  31 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  29.5 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  36.32 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  28.4 
 
 		 414 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  34.21 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  31.47 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4097  rod shape-determining protein MreC  30.42 
 
 		 355 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  29.57 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  30.57 
 
 		 299 aa  112  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  29.14 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0498  rod shape-determining protein MreC  29.14 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000920661  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  31.3 
 
 		 346 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  26.48 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3471  rod shape-determining protein MreC  29.28 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0021778  normal  0.815632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0480  rod shape-determining protein MreC  29.28 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.589731  normal  0.326651 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  33.51 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  33.51 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  29.14 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3647  rod shape-determining protein MreC  29.28 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0178406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  31.13 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  27.64 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  30.48 
 
 		 328 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  29.11 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  31.16 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  27.62 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  27.21 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  27.65 
 
 		 292 aa  106  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  32.5 
 
 		 288 aa  106  7e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  31.16 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  29.2 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  30.61 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  33.66 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  27.88 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  28.93 
 
 		 369 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 292 aa  102  9e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  28.16 
 
 		 357 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  28.16 
 
 		 357 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  29.28 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  28.16 
 
 		 357 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  27.01 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  28.16 
 
 		 357 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  28.16 
 
 		 357 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  28.16 
 
 		 357 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  33.17 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  28.16 
 
 		 357 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  27.86 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  28.52 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  28.36 
 
 		 296 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  31.38 
 
 		 273 aa  100  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  29.27 
 
 		 367 aa  99.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  31.73 
 
 		 288 aa  99  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  32 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  32.11 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  29.34 
 
 		 407 aa  97.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  30.36 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3753  rod shape-determining protein MreC  32.58 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000670381  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  27.97 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  27.97 
 
 		 358 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  27.97 
 
 		 358 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  27.34 
 
 		 286 aa  96.7  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  27.6 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  29.64 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3834  rod shape-determining protein MreC  27.91 
 
 		 383 aa  94  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0283563  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  28.09 
 
 		 356 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  28.09 
 
 		 356 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  31.49 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  28.17 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3737  rod shape-determining protein MreC  32.71 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00218266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  35.67 
 
 		 305 aa  91.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  29.82 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  27.6 
 
 		 304 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>