267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0845 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
302 aa  613  1e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
302 aa  613  1e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  40.62 
 
 
292 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  40.62 
 
 
292 aa  222  6e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  36.79 
 
 
317 aa  209  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  41.77 
 
 
286 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  40.37 
 
 
329 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  40.37 
 
 
330 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  36.71 
 
 
293 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  38.74 
 
 
318 aa  199  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  37.41 
 
 
309 aa  199  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  39.73 
 
 
328 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  40.47 
 
 
359 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  39.71 
 
 
362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  40.47 
 
 
357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  37.64 
 
 
334 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  39.62 
 
 
325 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  38.93 
 
 
332 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  37.84 
 
 
267 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  39.23 
 
 
330 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  42 
 
 
292 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  37.05 
 
 
281 aa  193  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  35.79 
 
 
291 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  39.22 
 
 
333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  36.8 
 
 
294 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  36.68 
 
 
299 aa  185  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  36.24 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  39.7 
 
 
338 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0498  rod shape-determining protein MreC  39.11 
 
 
336 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000920661  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  36.4 
 
 
286 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  39.11 
 
 
336 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  40.38 
 
 
300 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  37.37 
 
 
298 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  39.11 
 
 
336 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3647  rod shape-determining protein MreC  38.2 
 
 
353 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0178406  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3737  rod shape-determining protein MreC  38.66 
 
 
320 aa  178  8e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00218266  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3471  rod shape-determining protein MreC  37.27 
 
 
353 aa  178  9e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0021778  normal  0.815632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0480  rod shape-determining protein MreC  37.27 
 
 
353 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.589731  normal  0.326651 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  40.27 
 
 
254 aa  177  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4097  rod shape-determining protein MreC  36.9 
 
 
355 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  37.59 
 
 
298 aa  176  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  38.93 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  41.36 
 
 
243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  37.23 
 
 
277 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  34.95 
 
 
296 aa  168  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  35.45 
 
 
414 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  38.46 
 
 
286 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3753  rod shape-determining protein MreC  37.07 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000670381  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  37.26 
 
 
316 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  37.26 
 
 
316 aa  159  6e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  37.25 
 
 
286 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  37 
 
 
351 aa  155  9e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  34 
 
 
326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  34.6 
 
 
282 aa  152  7e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  31.82 
 
 
285 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  35.22 
 
 
306 aa  149  8e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  35.15 
 
 
331 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  35.15 
 
 
331 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  35.15 
 
 
331 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  36.63 
 
 
448 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  30.94 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  35.27 
 
 
407 aa  139  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3834  rod shape-determining protein MreC  34.48 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0283563  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  30.59 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  34.75 
 
 
279 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  34.75 
 
 
279 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  28.37 
 
 
311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0264  rod shape-determining protein MreC  34.12 
 
 
327 aa  129  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.032676  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  34.78 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  30.45 
 
 
358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  30.45 
 
 
358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  30.45 
 
 
358 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  33.07 
 
 
357 aa  126  4.0000000000000003e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  31.95 
 
 
369 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  30.08 
 
 
355 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  32.1 
 
 
367 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  30.83 
 
 
367 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0457  rod shape-determining protein MreC  33.45 
 
 
367 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00301189  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 
369 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  30.08 
 
 
356 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4410  rod shape-determining protein MreC  34.31 
 
 
334 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000283267  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  30.08 
 
 
356 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 
324 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  30.4 
 
 
305 aa  122  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0253  rod shape-determining protein MreC  34.51 
 
 
327 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00109654  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  33.2 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03109  cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreC  33.1 
 
 
367 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0024282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0457  rod shape-determining protein MreC  33.1 
 
 
367 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000354374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3545  rod shape-determining protein MreC  33.1 
 
 
367 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000398804  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3281  rod shape-determining protein MreC  33.1 
 
 
361 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000057378  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3439  rod shape-determining protein MreC  33.1 
 
 
367 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4566  rod shape-determining protein MreC  32.41 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000293229  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3733  rod shape-determining protein MreC  33.1 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011451  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  30.4 
 
 
305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03060  hypothetical protein  33.1 
 
 
367 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00317154  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  30.95 
 
 
307 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  28.95 
 
 
357 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  28.95 
 
 
357 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  28.95 
 
 
357 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>