289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2547 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 286 aa  571  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  43.46 
 
 		 285 aa  252  6e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  41.63 
 
 		 274 aa  209  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  39.1 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  36.23 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  39.52 
 
 		 273 aa  178  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  36.03 
 
 		 288 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  33.94 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  36.23 
 
 		 283 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  35.47 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  36.23 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  33.92 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  34.18 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  31.29 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  31.93 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  35.07 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  32.77 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  35.07 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  31.97 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 		 287 aa  142  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  34.7 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  34.34 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  30.8 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  34.33 
 
 		 283 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  33.96 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  34.33 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  35.36 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  32.78 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  34.06 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  31.6 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 		 359 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 		 274 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  33.61 
 
 		 273 aa  126  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  32.22 
 
 		 276 aa  125  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  35.27 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  33.78 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  31.94 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  24.65 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  35.41 
 
 		 285 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  30.88 
 
 		 288 aa  118  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  31.23 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  30.51 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  28.62 
 
 		 292 aa  115  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  31.67 
 
 		 283 aa  115  7.999999999999999e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  33.5 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  30.92 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  28.73 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  28.15 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3647  rod shape-determining protein MreC  31.62 
 
 		 353 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0178406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  31.19 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3471  rod shape-determining protein MreC  31.62 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0021778  normal  0.815632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0480  rod shape-determining protein MreC  31.62 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.589731  normal  0.326651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  30.7 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  32.18 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  29.88 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  29.93 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  29.93 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4097  rod shape-determining protein MreC  30.88 
 
 		 355 aa  106  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  29.48 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  26.79 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  30.86 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  30.86 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  32.08 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0498  rod shape-determining protein MreC  30.86 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000920661  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  30.86 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  30.36 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  29.69 
 
 		 331 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  29.69 
 
 		 331 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  29.69 
 
 		 331 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3737  rod shape-determining protein MreC  31.6 
 
 		 320 aa  102  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00218266  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  32.55 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  34.5 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  29.59 
 
 		 274 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1413  rod shape-determining protein MreC  32.08 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0196901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  30.11 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  28.3 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0711  rod shape-determining protein MreC  28.52 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  31.06 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  28.46 
 
 		 286 aa  99.4  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  28.97 
 
 		 285 aa  99.4  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  29 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  28.7 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  27.96 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  32.46 
 
 		 249 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  32.46 
 
 		 249 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  29.69 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  28.64 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  27.64 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  25.72 
 
 		 324 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0286  rod shape-determining protein MreC  29.2 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  25.48 
 
 		 414 aa  94.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  30.85 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>