282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2591 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
281 aa  562  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  37.23 
 
 
274 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  35.45 
 
 
274 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  38.01 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  35.74 
 
 
274 aa  172  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  41.99 
 
 
277 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  38.1 
 
 
273 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  36.6 
 
 
272 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  37.27 
 
 
274 aa  145  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  35.07 
 
 
272 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  27.78 
 
 
285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  31.88 
 
 
357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  28.37 
 
 
296 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  34.15 
 
 
359 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  32.33 
 
 
304 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  28.98 
 
 
304 aa  122  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  31.94 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  33.49 
 
 
285 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  28.78 
 
 
287 aa  116  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  31.09 
 
 
317 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  30.3 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  35.53 
 
 
273 aa  113  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  25.93 
 
 
283 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  32.86 
 
 
283 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  33.21 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  28.35 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  31.19 
 
 
306 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  30.18 
 
 
292 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  31.86 
 
 
346 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  32.26 
 
 
275 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  32.26 
 
 
291 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  37.5 
 
 
274 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 
299 aa  106  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  29.58 
 
 
277 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  31.9 
 
 
291 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  32.13 
 
 
291 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  28.28 
 
 
288 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  29.74 
 
 
286 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 
296 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  31.66 
 
 
348 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  29.09 
 
 
311 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  31.66 
 
 
348 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  29 
 
 
285 aa  102  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  29.83 
 
 
306 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 
271 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  26.1 
 
 
294 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  27.91 
 
 
316 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  29.58 
 
 
338 aa  99.4  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  32.64 
 
 
288 aa  98.2  1e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  27.48 
 
 
316 aa  98.2  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  32.46 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  28.96 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  28.99 
 
 
324 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1413  rod shape-determining protein MreC  34.17 
 
 
307 aa  96.3  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0196901  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  29.49 
 
 
407 aa  96.3  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  27.1 
 
 
309 aa  96.3  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  31.2 
 
 
448 aa  95.9  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  29.43 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  33.83 
 
 
292 aa  95.5  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  27.99 
 
 
286 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
288 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  30.65 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  27.4 
 
 
286 aa  94.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  29.19 
 
 
367 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  27.51 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  31.11 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  32.86 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  31.34 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  30.55 
 
 
276 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  29.11 
 
 
243 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  26.01 
 
 
311 aa  94  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  29.95 
 
 
315 aa  93.6  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  27.34 
 
 
293 aa  93.2  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  33.99 
 
 
292 aa  93.2  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  31.75 
 
 
267 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 
307 aa  92.8  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
288 aa  92.4  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  29.77 
 
 
300 aa  92  9e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  28.5 
 
 
286 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  28.37 
 
 
336 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  30.46 
 
 
414 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  27.75 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  35.67 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  29.19 
 
 
369 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  26.92 
 
 
334 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  28.62 
 
 
285 aa  90.1  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  30.18 
 
 
288 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  28.99 
 
 
257 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  28.78 
 
 
369 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  26.45 
 
 
285 aa  89  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  29.74 
 
 
283 aa  89  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1380  rod shape-determining protein MreC  24.15 
 
 
276 aa  89  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  27.51 
 
 
291 aa  88.6  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  26.24 
 
 
356 aa  88.6  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  29.09 
 
 
249 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  29.09 
 
 
249 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  27.34 
 
 
362 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  31.73 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  29.07 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>