188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7284 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7284  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 290 aa  563  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1540  rod shape-determining protein MreC  43.64 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.211291  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0749  rod shape-determining protein MreC  45.45 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  40 
 
 		 366 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7281  Cell shape-determining protein-like protein  40.83 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.205543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  41.32 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5268  rod shape-determining protein MreC  35.54 
 
 		 336 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1212  rod shape-determining protein MreC  36.21 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3464  rod shape-determining protein MreC  35.21 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.187709  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  31.34 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1686  rod shape-determining protein MreC  36.92 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0852  rod shape-determining protein MreC  34.07 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0888455 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  25.86 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  26.56 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  22.94 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  26.74 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  27.18 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  30.1 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  27.34 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  27.15 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  26.85 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  24.81 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  28.46 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  25.52 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09210  cell shape-determining protein  28.83 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.76787 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  29.66 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1528  rod shape-determining protein MreC  31.2 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.187391  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  24.73 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  27.6 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  28.3 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  28.62 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0767  rod shape-determining protein MreC  36.05 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0236544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  27.55 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  31.08 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  26.9 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  26.9 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  23.84 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  29.79 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  34.19 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  27.9 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  27.72 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  27.46 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  26.97 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  27.69 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  27.69 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  30.58 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  27.18 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  30.56 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  29.82 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0106  Rod shape-determining protein MreC  22.88 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  26.13 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  27.31 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  27.59 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  28.86 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  26.84 
 
 		 333 aa  63.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  24.71 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  24.71 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  26.23 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1380  rod shape-determining protein MreC  24.89 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  28.09 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4776  rod shape-determining protein MreC  25.76 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.17516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  27.31 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  28.36 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  27.68 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  28.99 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  27.4 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  21.63 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  28.99 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  30.41 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  30.88 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  27.42 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  29.63 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  28.18 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  26.21 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  24.91 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  27.61 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  24.61 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  30.17 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  26.4 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  29.27 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  28 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  28.69 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4600  rod shape-determining protein MreC  28.81 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  29.23 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  26.77 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  27.49 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  28.81 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  23.44 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  29.23 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  25.56 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  23.58 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  29.23 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  28.33 
 
 		 362 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  26.13 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  24.38 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  28.45 
 
 		 357 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  29.05 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>